96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2999 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  919    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  63.04 
 
 
362 aa  457  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  63.31 
 
 
363 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  63.87 
 
 
363 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  59.83 
 
 
359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  56.18 
 
 
379 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  60.17 
 
 
393 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  57.41 
 
 
394 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  57.87 
 
 
394 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  47.4 
 
 
361 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  47.7 
 
 
374 aa  316  7e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  48.43 
 
 
376 aa  296  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  45.74 
 
 
363 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  45.22 
 
 
372 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  48.22 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  43.87 
 
 
351 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  49.67 
 
 
366 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  49.67 
 
 
371 aa  280  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  49.28 
 
 
386 aa  280  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  43.82 
 
 
351 aa  279  9e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  48.73 
 
 
373 aa  279  9e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  45.11 
 
 
358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  44.96 
 
 
358 aa  273  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  44.41 
 
 
358 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  45.45 
 
 
369 aa  270  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  44.97 
 
 
376 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  43.9 
 
 
358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  46.47 
 
 
382 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  45.88 
 
 
382 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  42.58 
 
 
389 aa  259  8e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  45.6 
 
 
382 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  38.83 
 
 
361 aa  229  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  38.18 
 
 
432 aa  226  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  35.85 
 
 
366 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  35.77 
 
 
366 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  37.33 
 
 
368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  35.97 
 
 
370 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  37.29 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  36.41 
 
 
367 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  35.75 
 
 
363 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  33.71 
 
 
364 aa  196  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  36.03 
 
 
368 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  35.96 
 
 
363 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  35.29 
 
 
363 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  34.96 
 
 
370 aa  193  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  33.52 
 
 
362 aa  193  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  35.67 
 
 
365 aa  190  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  37.68 
 
 
365 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  36.67 
 
 
375 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  36.41 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  36.41 
 
 
375 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  29.46 
 
 
366 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  25.13 
 
 
388 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  27.58 
 
 
372 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  27.13 
 
 
376 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  26.08 
 
 
368 aa  96.7  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  26.16 
 
 
368 aa  96.3  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  30.95 
 
 
376 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  26.1 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  25.89 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  27.49 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  28.61 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  28.53 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  27.37 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  27.32 
 
 
375 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  27.85 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  27.66 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  27.5 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  27.49 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  27.47 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  27.35 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  29.8 
 
 
322 aa  64.3  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  32.16 
 
 
439 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  27.35 
 
 
373 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  24.18 
 
 
353 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  28.85 
 
 
569 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0099  CgeB family protein  27.66 
 
 
558 aa  55.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  24.55 
 
 
325 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  23.66 
 
 
325 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  33.64 
 
 
1288 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  29.82 
 
 
638 aa  50.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4970  bifunctional hypothetical protein/glycosyltransferase  19.37 
 
 
1176 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  24.05 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  32.2 
 
 
283 aa  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2021  CgeB family protein  29.3 
 
 
435 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00309286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  23.22 
 
 
331 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  22.43 
 
 
331 aa  47  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0250  CgeB family protein  31.73 
 
 
649 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0474732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1715  CgeB family protein  29.81 
 
 
570 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2849  hypothetical protein  44.16 
 
 
546 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  22.32 
 
 
331 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  25.26 
 
 
1162 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1257  CgeB family protein  32.38 
 
 
591 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
1737 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  28.46 
 
 
394 aa  43.5  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  30.84 
 
 
377 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>