86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2169 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2169  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  732    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0445618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2428  hypothetical protein  88.08 
 
 		 369 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759997  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0517  hypothetical protein  98.37 
 
 		 369 aa  724    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3890  hypothetical protein  68.44 
 
 		 376 aa  502  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0848246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5582  hypothetical protein  70.91 
 
 		 376 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0303193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2777  hypothetical protein  65.95 
 
 		 376 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283219  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2074  hypothetical protein  61.94 
 
 		 385 aa  421  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136102  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3221  hypothetical protein  60.77 
 
 		 376 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1065  hypothetical protein  61.5 
 
 		 361 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1193  hypothetical protein  61.5 
 
 		 361 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376035  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2533  hypothetical protein  56.52 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000023421 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1124  hypothetical protein  61.22 
 
 		 361 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0247  hypothetical protein  59.78 
 
 		 375 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0193  hypothetical protein  60.61 
 
 		 375 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1267  hypothetical protein  60.67 
 
 		 373 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0436  hypothetical protein  60.06 
 
 		 370 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0507  hypothetical protein  60.86 
 
 		 373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1688  hypothetical protein  55.43 
 
 		 368 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3263  glycosyl transferase, group 1  48.77 
 
 		 372 aa  332  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.364975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1318  hypothetical protein  66.29 
 
 		 439 aa  229  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2692  hypothetical protein  28.61 
 
 		 362 aa  91.3  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3211  hypothetical protein  28.61 
 
 		 359 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0958  hypothetical protein  28.31 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2531  hypothetical protein  25.27 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  27.58 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2999  hypothetical protein  28.61 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.932041  normal  0.400832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1690  hypothetical protein  24.73 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1670  hypothetical protein  28.62 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0245  hypothetical protein  28.25 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0191  hypothetical protein  28.25 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2775  hypothetical protein  25.66 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  26.17 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1138  hypothetical protein  26.11 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358435  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  27.27 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  27.86 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3892  hypothetical protein  26.79 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  26.55 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0932  hypothetical protein  28.99 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525658  normal  0.176041 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5584  hypothetical protein  27.34 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348361  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0192  hypothetical protein  27.7 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2427  hypothetical protein  26.75 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2426  hypothetical protein  27.3 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.577866 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  26.37 
 
 		 362 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0246  hypothetical protein  26.96 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0558374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1317  hypothetical protein  28.24 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1265  hypothetical protein  26.19 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192794  normal  0.0171545 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0516  hypothetical protein  26.96 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2072  hypothetical protein  28.92 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.236468  normal  0.0105803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0438  hypothetical protein  28.57 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  28.07 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  25.52 
 
 		 370 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  26.6 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0505  hypothetical protein  24.71 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2073  hypothetical protein  28.18 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.777573  normal  0.0115222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1059  hypothetical protein  27.73 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  29.46 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2167  hypothetical protein  25.54 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3215  hypothetical protein  25.44 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0515  hypothetical protein  26.61 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  27.03 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  29.46 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  26.19 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3261  hypothetical protein  25.19 
 
 		 374 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1058  hypothetical protein  34.62 
 
 		 382 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0304  hypothetical protein  23.89 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1117  hypothetical protein  28.07 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0874  hypothetical protein  26.74 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.442183  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1186  hypothetical protein  33.82 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1187  hypothetical protein  28.57 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1316  hypothetical protein  27.06 
 
 		 369 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  26.47 
 
 		 394 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  32.4 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1118  hypothetical protein  27.71 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3262  hypothetical protein  25.21 
 
 		 366 aa  49.7  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.403362 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  38.37 
 
 		 1049 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  22.77 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 		 673 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4970  bifunctional hypothetical protein/glycosyltransferase  22.48 
 
 		 1176 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1889  hypothetical protein  25.81 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 		 1162 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0539  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 		 377 aa  43.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0925  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 376 aa  43.1  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  23.17 
 
 		 360 aa  42.7  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  27.45 
 
 		 402 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  24.91 
 
 		 537 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.848309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>