24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1582 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1582  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  674    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0378  hypothetical protein  31.87 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0536154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0985  hypothetical protein  29.55 
 
 		 346 aa  105  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505379 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1617  hypothetical protein  28.96 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1689  hypothetical protein  30.8 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2532  hypothetical protein  29.96 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000423919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  24.56 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0936  hypothetical protein  25 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2776  hypothetical protein  27.55 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1139  hypothetical protein  29.47 
 
 		 432 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1614  hypothetical protein  26.61 
 
 		 442 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0590897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0031  hypothetical protein  23 
 
 		 388 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.569137  normal  0.0167749 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3891  hypothetical protein  26.53 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1632  CgeB family protein  30.08 
 
 		 569 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1746  CgeB family protein  27.62 
 
 		 424 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.532934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0437  hypothetical protein  29.29 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1266  hypothetical protein  27.32 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0285098 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5583  hypothetical protein  25.71 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0202038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3214  hypothetical protein  29.09 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0506  hypothetical protein  28.23 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0111  CgeB family protein  26.19 
 
 		 394 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.94459  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2168  hypothetical protein  26.7 
 
 		 363 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0794461 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  27.6 
 
 		 322 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  22.95 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>