14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49898 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_49898  predicted protein  100 
 
 
810 aa  1685    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49883  predicted protein  54.7 
 
 
554 aa  469  1.0000000000000001e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0580309  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49960  predicted protein  70.03 
 
 
398 aa  471  1.0000000000000001e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49231  predicted protein  47.35 
 
 
377 aa  347  4e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46968  predicted protein  42.82 
 
 
475 aa  276  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47447  predicted protein  30.29 
 
 
613 aa  151  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  32.93 
 
 
1162 aa  54.3  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0421  hypothetical protein  29.52 
 
 
377 aa  52  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
207 aa  50.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  33.98 
 
 
1288 aa  50.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1959  hypothetical protein  26.56 
 
 
237 aa  45.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00110693  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0607  hypothetical protein  27.45 
 
 
225 aa  44.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.525552  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2228  hypothetical protein  25.64 
 
 
353 aa  44.3  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  26.92 
 
 
395 aa  44.3  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>