26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1959 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1959  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  489  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00110693  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0607  hypothetical protein  57.66 
 
 		 225 aa  264  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.525552  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00978  hypothetical protein  41.63 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04071  hypothetical protein  39.01 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2743  methyltransferase type 12  30.89 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2675  hypothetical protein  30.53 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4251  Methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 275 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  28.68 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  26.89 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  40.51 
 
 		 232 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0024  hypothetical protein  45.65 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49898  predicted protein  26.56 
 
 		 810 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3122  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.21 
 
 		 516 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  31.13 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0141  methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  23.4 
 
 		 390 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1024  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 341 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0134  Methyltransferase type 11  23.66 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0559128  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  31.91 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0025  hypothetical protein  38.98 
 
 		 141 aa  42.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.97 
 
 		 256 aa  42  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49960  predicted protein  24.64 
 
 		 398 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 222 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1967  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 205 aa  42  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247802  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 436 aa  42  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>