50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4251 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4251  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 275 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2743  methyltransferase type 12  28.39 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04071  hypothetical protein  35.46 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2675  hypothetical protein  26.09 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0301  hypothetical protein  29.1 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1959  hypothetical protein  30.87 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00110693  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00978  hypothetical protein  32.9 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0607  hypothetical protein  31.9 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.525552  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47187  predicted protein  31.4 
 
 		 362 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0025  hypothetical protein  44.23 
 
 		 141 aa  49.7  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.65 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 2490 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.93 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4425  methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102836  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.93 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4004  hypothetical protein  26.62 
 
 		 327 aa  46.2  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413666  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5243  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204365  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.46 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.87 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 457 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.87 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.87 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 487 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1446  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  27.97 
 
 		 388 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220597  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  32.35 
 
 		 783 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  35.8 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  36.99 
 
 		 332 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  30.77 
 
 		 203 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.46 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1480  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  28.07 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.15 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.27 
 
 		 231 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 		 195 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1141  methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.98 
 
 		 229 aa  43.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 335 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.76 
 
 		 239 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  32 
 
 		 515 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.92 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  32.47 
 
 		 185 aa  42.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 634 aa  42.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.08 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 210 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  38.67 
 
 		 231 aa  42.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 235 aa  42.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  30.51 
 
 		 213 aa  42.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.9 
 
 		 232 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.76 
 
 		 232 aa  42  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>