67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2235 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  100 
 
 		 648 aa  1320    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  29.42 
 
 		 629 aa  263  6.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  30.87 
 
 		 623 aa  232  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  30.36 
 
 		 618 aa  217  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  28.75 
 
 		 616 aa  196  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  24.95 
 
 		 626 aa  152  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  25.17 
 
 		 758 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  29.73 
 
 		 470 aa  150  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  26.31 
 
 		 671 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  23.89 
 
 		 578 aa  129  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2415  hypothetical protein  21.57 
 
 		 656 aa  98.2  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.174354  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  27.27 
 
 		 607 aa  95.9  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  27 
 
 		 605 aa  90.9  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  26.57 
 
 		 605 aa  88.2  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  25.54 
 
 		 605 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  28.93 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  28.93 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  25.81 
 
 		 649 aa  77.8  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  20.89 
 
 		 589 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  24.8 
 
 		 577 aa  75.5  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  24.87 
 
 		 638 aa  72.8  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  27.16 
 
 		 661 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  28.09 
 
 		 578 aa  69.7  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  23.42 
 
 		 666 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  22.67 
 
 		 629 aa  68.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  22.76 
 
 		 635 aa  68.6  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  24.15 
 
 		 632 aa  68.2  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  23.83 
 
 		 891 aa  67.8  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  25.85 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  26.72 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  25.19 
 
 		 647 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  24.05 
 
 		 638 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  25 
 
 		 604 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  24.84 
 
 		 653 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  20.25 
 
 		 627 aa  59.7  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1458  hypothetical protein  23.06 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  25.68 
 
 		 625 aa  58.2  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  27.45 
 
 		 833 aa  57.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1044  protein of unknown function DUF115  25 
 
 		 560 aa  57.4  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  26.72 
 
 		 617 aa  57  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  25.42 
 
 		 570 aa  57  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  24.43 
 
 		 608 aa  56.2  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  23.38 
 
 		 509 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  28.41 
 
 		 626 aa  55.5  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  22.58 
 
 		 702 aa  55.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  22.07 
 
 		 1179 aa  55.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 839 aa  54.7  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  23.04 
 
 		 812 aa  54.7  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  25.31 
 
 		 654 aa  52.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  25.3 
 
 		 841 aa  52.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  24.77 
 
 		 833 aa  51.2  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  26.04 
 
 		 821 aa  50.8  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  20.17 
 
 		 431 aa  50.4  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 826 aa  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  21.14 
 
 		 700 aa  49.3  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  20.31 
 
 		 822 aa  48.5  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  22.94 
 
 		 841 aa  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  24.2 
 
 		 662 aa  48.1  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  24.03 
 
 		 430 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  23.73 
 
 		 441 aa  47  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  20.19 
 
 		 823 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  21.14 
 
 		 825 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  22.82 
 
 		 824 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 826 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 826 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  23.4 
 
 		 446 aa  44.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  30.91 
 
 		 638 aa  43.9  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>