74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1780 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  100 
 
 
626 aa  1264    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  32.81 
 
 
629 aa  207  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  28.36 
 
 
623 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  25.05 
 
 
648 aa  153  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  27.18 
 
 
758 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  24.79 
 
 
618 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  24.45 
 
 
616 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  25.66 
 
 
578 aa  106  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  23.56 
 
 
671 aa  104  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  22.11 
 
 
470 aa  101  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  23.71 
 
 
507 aa  89.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  29.74 
 
 
826 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  25.78 
 
 
589 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  23.53 
 
 
661 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2415  hypothetical protein  23.02 
 
 
656 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.174354  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  26.12 
 
 
430 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  25.37 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  23.06 
 
 
632 aa  75.5  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  23.83 
 
 
429 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  22.25 
 
 
666 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  26.8 
 
 
431 aa  72  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  25.43 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  22.05 
 
 
638 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  26.11 
 
 
812 aa  70.1  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  25.11 
 
 
431 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
826 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
826 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  24.05 
 
 
700 aa  65.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  22.1 
 
 
1179 aa  64.7  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  26.59 
 
 
442 aa  64.3  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  26.22 
 
 
442 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 
826 aa  63.5  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  20 
 
 
617 aa  62  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  23.64 
 
 
649 aa  62  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  24.52 
 
 
570 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  21.4 
 
 
605 aa  61.6  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  24.92 
 
 
833 aa  60.8  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1044  protein of unknown function DUF115  18.87 
 
 
560 aa  60.8  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  22.5 
 
 
638 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  23.27 
 
 
653 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  21.19 
 
 
605 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  22.99 
 
 
607 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  28.41 
 
 
833 aa  58.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  24.83 
 
 
446 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  22.53 
 
 
627 aa  58.5  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  28.33 
 
 
891 aa  58.2  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  29.75 
 
 
673 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  21.1 
 
 
647 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  30.57 
 
 
435 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  40.43 
 
 
638 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  30.57 
 
 
435 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  22.5 
 
 
821 aa  55.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  22.64 
 
 
820 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  25.61 
 
 
578 aa  55.5  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 
822 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  24.55 
 
 
509 aa  54.7  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  19.23 
 
 
822 aa  54.3  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  27.85 
 
 
841 aa  53.9  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  23.91 
 
 
841 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  24.58 
 
 
629 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  26.92 
 
 
676 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01241  hypothetical protein  23.11 
 
 
671 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.730155 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  21.85 
 
 
635 aa  52.4  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  23.44 
 
 
605 aa  51.6  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  27.07 
 
 
440 aa  51.2  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
839 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  20.41 
 
 
577 aa  49.7  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  19.34 
 
 
626 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  26.11 
 
 
837 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  21.81 
 
 
662 aa  48.1  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  19.08 
 
 
604 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  18.65 
 
 
823 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  24.78 
 
 
433 aa  44.3  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  26.36 
 
 
871 aa  44.3  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>