67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02911 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  100 
 
 
700 aa  1455    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  27.82 
 
 
702 aa  277  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  28.14 
 
 
1179 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  26.29 
 
 
676 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  26.07 
 
 
645 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  24.76 
 
 
826 aa  84  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  26.3 
 
 
812 aa  82.8  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  25.13 
 
 
618 aa  82.4  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  25.53 
 
 
673 aa  77.8  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  23.84 
 
 
578 aa  76.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  25.08 
 
 
824 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01241  hypothetical protein  21.93 
 
 
671 aa  71.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.730155 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  24.27 
 
 
604 aa  69.7  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  28.24 
 
 
821 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  30.05 
 
 
841 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  29.65 
 
 
823 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  29.34 
 
 
841 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  24.05 
 
 
626 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 
826 aa  65.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  24.84 
 
 
833 aa  65.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  21.78 
 
 
470 aa  64.7  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  26.15 
 
 
833 aa  63.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  22.52 
 
 
661 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  22.68 
 
 
629 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  26.7 
 
 
820 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  22.57 
 
 
647 aa  60.8  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  21.7 
 
 
638 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  21.58 
 
 
629 aa  59.7  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  21.73 
 
 
653 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  20.98 
 
 
635 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  22.76 
 
 
625 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 
822 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  26.27 
 
 
578 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  23.62 
 
 
671 aa  58.5  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  22.6 
 
 
607 aa  58.2  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  21.11 
 
 
626 aa  57  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  25.63 
 
 
837 aa  57  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 
839 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  21.13 
 
 
666 aa  55.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  21.28 
 
 
662 aa  56.6  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  21.61 
 
 
649 aa  55.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  27.23 
 
 
822 aa  55.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  22.72 
 
 
605 aa  55.5  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
826 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
826 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  22.35 
 
 
617 aa  55.1  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  21.72 
 
 
605 aa  54.3  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  23.75 
 
 
507 aa  52.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  23.66 
 
 
891 aa  51.6  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  22 
 
 
429 aa  51.2  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  25.63 
 
 
509 aa  50.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  23.71 
 
 
825 aa  50.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  24.1 
 
 
616 aa  50.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  23.19 
 
 
627 aa  50.4  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  21.05 
 
 
570 aa  50.4  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  21.14 
 
 
648 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  21.53 
 
 
632 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  22.06 
 
 
430 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  21.79 
 
 
577 aa  47.8  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  23.46 
 
 
871 aa  47  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  21.52 
 
 
623 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  25.21 
 
 
654 aa  46.6  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  21.81 
 
 
638 aa  46.2  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  21.13 
 
 
608 aa  45.4  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  27.66 
 
 
435 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  27.66 
 
 
435 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  20.96 
 
 
605 aa  44.3  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>