52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0627 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  100 
 
 
871 aa  1788    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  27.43 
 
 
841 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
839 aa  296  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  27.24 
 
 
837 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  25.74 
 
 
826 aa  253  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  26.56 
 
 
833 aa  242  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
826 aa  237  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
826 aa  237  7e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  29.98 
 
 
821 aa  227  9e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  25.46 
 
 
841 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  24.77 
 
 
825 aa  208  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  31.18 
 
 
812 aa  206  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  24.17 
 
 
823 aa  197  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  23.83 
 
 
822 aa  196  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 
826 aa  195  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  23.89 
 
 
824 aa  188  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 
822 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  25.45 
 
 
820 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  30.61 
 
 
833 aa  184  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  29.56 
 
 
578 aa  73.9  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  22.95 
 
 
629 aa  67  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  29.13 
 
 
446 aa  67  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  24.91 
 
 
470 aa  61.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  24.09 
 
 
1179 aa  59.3  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  22.87 
 
 
635 aa  57.4  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  27.06 
 
 
616 aa  57  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  25.32 
 
 
666 aa  56.2  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  23.46 
 
 
629 aa  56.6  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  42.19 
 
 
577 aa  56.2  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  21.58 
 
 
638 aa  54.7  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  26.55 
 
 
507 aa  54.7  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  25.81 
 
 
431 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  23.22 
 
 
605 aa  53.9  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  25 
 
 
608 aa  53.5  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  24.53 
 
 
578 aa  53.1  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  24.47 
 
 
570 aa  53.5  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  23.21 
 
 
618 aa  53.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  24.64 
 
 
607 aa  52.8  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  22.87 
 
 
653 aa  52.8  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  21.98 
 
 
626 aa  49.3  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  22.83 
 
 
891 aa  49.3  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  26.59 
 
 
430 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  21.72 
 
 
617 aa  48.5  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  20.4 
 
 
638 aa  48.5  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  23.46 
 
 
700 aa  47  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  25.1 
 
 
433 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  19.68 
 
 
671 aa  46.6  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  21.69 
 
 
632 aa  46.6  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  21.21 
 
 
429 aa  46.6  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  23.56 
 
 
605 aa  46.2  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  20.58 
 
 
627 aa  45.1  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  25.23 
 
 
440 aa  44.3  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>