66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1638 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  100 
 
 		 661 aa  1346    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  41.79 
 
 		 666 aa  483  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  38.01 
 
 		 604 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  38.44 
 
 		 635 aa  365  2e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  38.86 
 
 		 629 aa  362  9e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  36.29 
 
 		 626 aa  356  6.999999999999999e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  37.58 
 
 		 625 aa  353  5e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  34.35 
 
 		 627 aa  352  8.999999999999999e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  36.76 
 
 		 632 aa  350  4e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  36.3 
 
 		 638 aa  335  1e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  33.97 
 
 		 653 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  34.17 
 
 		 649 aa  316  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  33.98 
 
 		 654 aa  314  3.9999999999999997e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  33.98 
 
 		 638 aa  312  1e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  40.62 
 
 		 578 aa  304  4.0000000000000003e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  32.83 
 
 		 647 aa  298  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  37.35 
 
 		 617 aa  290  7e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  31.49 
 
 		 607 aa  206  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  29.01 
 
 		 605 aa  203  7e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  30.06 
 
 		 605 aa  201  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  29.72 
 
 		 605 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  29.51 
 
 		 608 aa  187  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  29.73 
 
 		 570 aa  159  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  26.36 
 
 		 891 aa  108  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  26.56 
 
 		 671 aa  106  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  27.63 
 
 		 618 aa  105  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  25.49 
 
 		 629 aa  95.1  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  29.6 
 
 		 616 aa  89.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  23.85 
 
 		 626 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  29.49 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  27.16 
 
 		 648 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 839 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  24.03 
 
 		 833 aa  65.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  23.06 
 
 		 623 aa  64.3  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  22.52 
 
 		 700 aa  63.9  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  25.99 
 
 		 470 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  23.67 
 
 		 702 aa  60.8  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1179 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  22.19 
 
 		 841 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  23.17 
 
 		 578 aa  59.7  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  24.19 
 
 		 841 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  25.95 
 
 		 833 aa  56.2  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  24.84 
 
 		 826 aa  55.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  22.66 
 
 		 431 aa  55.1  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  22.46 
 
 		 821 aa  53.5  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  25.41 
 
 		 837 aa  53.5  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  22.82 
 
 		 430 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  23.78 
 
 		 662 aa  52.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  27.88 
 
 		 446 aa  52  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  24.12 
 
 		 441 aa  52  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  25 
 
 		 645 aa  51.6  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2415  hypothetical protein  20.57 
 
 		 656 aa  51.2  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.174354  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01241  hypothetical protein  25 
 
 		 671 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.730155 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  22.38 
 
 		 824 aa  49.7  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 826 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 826 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  22.55 
 
 		 509 aa  47.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  22.76 
 
 		 823 aa  47.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  24.29 
 
 		 673 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  22.93 
 
 		 825 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 		 822 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  25.58 
 
 		 812 aa  45.8  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  34.67 
 
 		 577 aa  44.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  22.42 
 
 		 820 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  27.27 
 
 		 435 aa  44.3  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  27.27 
 
 		 435 aa  44.3  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>