60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0376 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  100 
 
 
647 aa  1320    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  80.89 
 
 
653 aa  1072    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  72.04 
 
 
649 aa  928    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  76.93 
 
 
638 aa  994    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  62.21 
 
 
654 aa  775    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  48.59 
 
 
638 aa  554  1e-156  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  46.25 
 
 
635 aa  491  1e-137  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  44.64 
 
 
617 aa  484  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  44.58 
 
 
629 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  43.39 
 
 
632 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  43.12 
 
 
626 aa  423  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  41.87 
 
 
625 aa  419  1e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  45.67 
 
 
604 aa  415  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  38.71 
 
 
666 aa  369  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  45.06 
 
 
578 aa  328  2.0000000000000001e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  33.11 
 
 
661 aa  302  1e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  31.79 
 
 
627 aa  265  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  34.59 
 
 
605 aa  242  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  34.1 
 
 
605 aa  241  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  34.38 
 
 
607 aa  241  4e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  32.63 
 
 
605 aa  239  1e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  34.23 
 
 
608 aa  231  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  29.03 
 
 
570 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  25.7 
 
 
671 aa  108  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  24.09 
 
 
618 aa  101  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  28.42 
 
 
891 aa  98.2  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  30.63 
 
 
470 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  22.37 
 
 
629 aa  70.5  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  23.15 
 
 
616 aa  70.1  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  24.22 
 
 
623 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  21.12 
 
 
826 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  25.18 
 
 
758 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  22.55 
 
 
1179 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  23.45 
 
 
823 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  25.19 
 
 
648 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  23.49 
 
 
507 aa  61.2  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  22.57 
 
 
700 aa  60.8  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  20.6 
 
 
841 aa  58.5  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  24.39 
 
 
645 aa  57.4  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  22.19 
 
 
430 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  26.56 
 
 
578 aa  56.6  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  21.12 
 
 
626 aa  55.8  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  24.11 
 
 
589 aa  54.7  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  22.22 
 
 
446 aa  54.3  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2415  hypothetical protein  21.16 
 
 
656 aa  52  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.174354  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  21.23 
 
 
430 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  24.66 
 
 
673 aa  50.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  20.94 
 
 
821 aa  50.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  22.36 
 
 
509 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  28.74 
 
 
676 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  21.13 
 
 
662 aa  46.6  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  27 
 
 
431 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 
826 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 
826 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  25.52 
 
 
441 aa  45.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  23.7 
 
 
824 aa  45.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  25.81 
 
 
702 aa  45.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  23.23 
 
 
833 aa  44.3  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  26.54 
 
 
442 aa  43.9  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01241  hypothetical protein  20.83 
 
 
671 aa  43.9  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.730155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>