76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1315 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  100 
 
 		 578 aa  1172    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  32.49 
 
 		 616 aa  209  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  27.43 
 
 		 629 aa  141  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  28.05 
 
 		 618 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  23.89 
 
 		 648 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  29.81 
 
 		 623 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  25.66 
 
 		 626 aa  107  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  28.46 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  25.77 
 
 		 577 aa  90.9  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  24.34 
 
 		 758 aa  90.9  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  26.67 
 
 		 507 aa  90.1  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  25.67 
 
 		 671 aa  82  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2415  hypothetical protein  21.44 
 
 		 656 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.174354  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  28.57 
 
 		 812 aa  77  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  23.84 
 
 		 700 aa  76.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  29.56 
 
 		 871 aa  73.9  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  28.57 
 
 		 629 aa  73.6  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  25 
 
 		 635 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2525  hypothetical protein  26.2 
 
 		 582 aa  72.8  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  22.07 
 
 		 891 aa  72.8  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  24.37 
 
 		 632 aa  70.5  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  29.57 
 
 		 833 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  25.2 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1044  protein of unknown function DUF115  21.39 
 
 		 560 aa  68.2  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  27.51 
 
 		 837 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  23.73 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  21.99 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 826 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 826 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  21.71 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  25.81 
 
 		 653 aa  64.3  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  26.49 
 
 		 841 aa  63.9  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  27.78 
 
 		 605 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  27.98 
 
 		 605 aa  60.8  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  25.68 
 
 		 608 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  27.03 
 
 		 617 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  23.17 
 
 		 661 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 839 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1458  hypothetical protein  27.38 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1179 aa  57.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  28.03 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  21.82 
 
 		 666 aa  57.4  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  20.44 
 
 		 841 aa  57.4  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  26.24 
 
 		 570 aa  57  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  22.69 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  26.02 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  22.65 
 
 		 824 aa  57  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  26.56 
 
 		 647 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  27.9 
 
 		 833 aa  56.6  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  25.1 
 
 		 649 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  27.27 
 
 		 638 aa  57  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  28.98 
 
 		 604 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  27.17 
 
 		 578 aa  55.5  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  26.1 
 
 		 626 aa  54.7  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  25.62 
 
 		 435 aa  54.3  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  25.62 
 
 		 435 aa  54.3  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  25 
 
 		 826 aa  53.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  21.17 
 
 		 821 aa  53.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  21.97 
 
 		 823 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  18.68 
 
 		 589 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  26.35 
 
 		 605 aa  51.6  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  22.05 
 
 		 429 aa  51.2  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  21.46 
 
 		 431 aa  50.8  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  24.1 
 
 		 638 aa  49.7  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  21.6 
 
 		 627 aa  49.3  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  21.2 
 
 		 826 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  24.57 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  24.39 
 
 		 433 aa  48.9  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  24.08 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  27.27 
 
 		 673 aa  48.5  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  25.52 
 
 		 625 aa  47.4  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  27.82 
 
 		 822 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  25.68 
 
 		 654 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  22.4 
 
 		 645 aa  46.2  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 822 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  22.16 
 
 		 820 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>