49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_01211 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  65.43 
 
 
673 aa  881    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  100 
 
 
676 aa  1386    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01241  hypothetical protein  29.05 
 
 
671 aa  88.2  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.730155 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  26.29 
 
 
700 aa  85.9  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  29.75 
 
 
638 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  26.01 
 
 
645 aa  65.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 
826 aa  65.1  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  32.48 
 
 
635 aa  62  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  30.49 
 
 
604 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  27.43 
 
 
666 aa  61.6  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  27.11 
 
 
1179 aa  61.6  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  29.52 
 
 
629 aa  60.8  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  27.85 
 
 
825 aa  59.7  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  29.14 
 
 
626 aa  59.3  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  25 
 
 
822 aa  58.5  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  24.73 
 
 
820 aa  57.4  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  27.23 
 
 
629 aa  57  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  25.77 
 
 
821 aa  57  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  26.11 
 
 
824 aa  56.2  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
822 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  22.47 
 
 
826 aa  55.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  26.15 
 
 
470 aa  55.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  30.06 
 
 
605 aa  54.7  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  28.03 
 
 
653 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  28.31 
 
 
578 aa  53.5  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  26.92 
 
 
626 aa  53.5  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  27.74 
 
 
442 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  27.74 
 
 
442 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  28.22 
 
 
607 aa  53.1  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  21.49 
 
 
702 aa  51.6  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  27.7 
 
 
812 aa  52  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  26.99 
 
 
654 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  26.7 
 
 
841 aa  51.2  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  23.94 
 
 
632 aa  50.8  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  23.23 
 
 
823 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  28.74 
 
 
647 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  22.33 
 
 
649 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  26.26 
 
 
833 aa  48.5  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  23.78 
 
 
431 aa  47.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  30.67 
 
 
605 aa  47.4  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  23.78 
 
 
617 aa  47  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  28.4 
 
 
638 aa  46.6  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  20.71 
 
 
837 aa  46.2  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  28.22 
 
 
605 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  28.48 
 
 
625 aa  46.6  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  28.03 
 
 
570 aa  45.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  21.47 
 
 
841 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  24.78 
 
 
446 aa  45.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  27.16 
 
 
662 aa  43.9  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>