58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1454 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  100 
 
 		 812 aa  1678    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  28.3 
 
 		 821 aa  281  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 839 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  28.46 
 
 		 841 aa  272  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  28.23 
 
 		 826 aa  271  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  26.75 
 
 		 820 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  25.87 
 
 		 822 aa  260  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  26.6 
 
 		 833 aa  258  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 822 aa  250  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  30.05 
 
 		 823 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  26.22 
 
 		 841 aa  244  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  26.9 
 
 		 825 aa  241  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  24.88 
 
 		 837 aa  239  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 826 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 826 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  25.87 
 
 		 833 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 826 aa  224  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  31.18 
 
 		 871 aa  206  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  26.49 
 
 		 824 aa  185  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  26.3 
 
 		 700 aa  82.8  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  29.46 
 
 		 618 aa  77  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  28.57 
 
 		 578 aa  77  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  25.6 
 
 		 616 aa  73.9  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  27.08 
 
 		 629 aa  71.6  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  26.11 
 
 		 626 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  28.07 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  22.78 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  29.11 
 
 		 577 aa  63.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  22.94 
 
 		 623 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1179 aa  62  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01241  hypothetical protein  27.8 
 
 		 671 aa  60.1  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.730155 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  26.64 
 
 		 435 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  26.64 
 
 		 435 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  37.7 
 
 		 570 aa  57  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  28.93 
 
 		 507 aa  57  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  22.14 
 
 		 430 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  26.53 
 
 		 671 aa  55.1  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  23.04 
 
 		 648 aa  54.7  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  27.89 
 
 		 673 aa  54.3  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  28.48 
 
 		 645 aa  53.9  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  23.99 
 
 		 605 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  23.29 
 
 		 433 aa  53.5  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  25.64 
 
 		 431 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  25.82 
 
 		 702 aa  52  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  27.7 
 
 		 676 aa  52  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  24.59 
 
 		 605 aa  51.6  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  22.87 
 
 		 429 aa  51.6  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  24.7 
 
 		 605 aa  51.6  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  25.84 
 
 		 607 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  23.55 
 
 		 442 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  23.55 
 
 		 442 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  22.88 
 
 		 891 aa  48.5  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  26.11 
 
 		 441 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  23.77 
 
 		 431 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  32.05 
 
 		 608 aa  47.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  22.93 
 
 		 430 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  25.58 
 
 		 661 aa  45.8  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  23.25 
 
 		 617 aa  45.1  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>