48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_01231 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  100 
 
 
673 aa  1375    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  65.43 
 
 
676 aa  907    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01241  hypothetical protein  26.81 
 
 
671 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.730155 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  25.53 
 
 
700 aa  77.8  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 
822 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
826 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  24.79 
 
 
820 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  24.15 
 
 
825 aa  65.1  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  26.32 
 
 
822 aa  64.3  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  22.86 
 
 
823 aa  63.9  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  26.38 
 
 
821 aa  63.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  24.37 
 
 
645 aa  61.2  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  26.99 
 
 
638 aa  60.8  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  23.91 
 
 
629 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  25 
 
 
841 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  29.75 
 
 
442 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  29.75 
 
 
442 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  24.12 
 
 
837 aa  57.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  28.38 
 
 
1179 aa  57.4  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  26.88 
 
 
635 aa  57.4  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  29.75 
 
 
626 aa  57  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  25.84 
 
 
632 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  25.91 
 
 
666 aa  55.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  26.17 
 
 
826 aa  55.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  25.15 
 
 
824 aa  54.7  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  27.89 
 
 
812 aa  54.3  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  24.76 
 
 
604 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  23.31 
 
 
841 aa  53.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  27.12 
 
 
833 aa  52  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  25.11 
 
 
446 aa  51.2  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  24.66 
 
 
647 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  20.34 
 
 
702 aa  50.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  50 
 
 
570 aa  50.4  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  43.14 
 
 
662 aa  49.3  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  28.12 
 
 
617 aa  49.3  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  23.21 
 
 
626 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  24.62 
 
 
470 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  27.27 
 
 
629 aa  48.9  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  27.27 
 
 
578 aa  48.5  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  24.07 
 
 
653 aa  48.5  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  25.88 
 
 
654 aa  48.1  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  29.68 
 
 
607 aa  48.1  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  25.17 
 
 
441 aa  47.8  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  24.03 
 
 
649 aa  47.8  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  28.05 
 
 
605 aa  47.4  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  24.29 
 
 
661 aa  46.2  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  23.46 
 
 
578 aa  46.6  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  23.08 
 
 
431 aa  45.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>