63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3273 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  64.96 
 
 		 822 aa  1105    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  60.8 
 
 		 823 aa  1013    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  58.31 
 
 		 821 aa  975    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  64.72 
 
 		 820 aa  1114    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  42.41 
 
 		 826 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  100 
 
 		 822 aa  1700    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  42.46 
 
 		 833 aa  654    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  44.31 
 
 		 841 aa  694    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  40.58 
 
 		 824 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  38.35 
 
 		 825 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  37.09 
 
 		 826 aa  549  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 826 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 826 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  29.83 
 
 		 841 aa  364  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  29.43 
 
 		 837 aa  355  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 839 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  26.73 
 
 		 833 aa  292  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  25.87 
 
 		 812 aa  260  8e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  23.83 
 
 		 871 aa  196  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  25.27 
 
 		 618 aa  73.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  25.62 
 
 		 629 aa  74.3  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  26.51 
 
 		 429 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  25.37 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  26.21 
 
 		 470 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  26.69 
 
 		 431 aa  66.6  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  25.96 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  25.48 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  26.32 
 
 		 673 aa  64.3  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  25.48 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  25 
 
 		 570 aa  62.8  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  25.82 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  24.81 
 
 		 441 aa  60.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  23.19 
 
 		 616 aa  59.7  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  24.24 
 
 		 435 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  24.24 
 
 		 435 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  25 
 
 		 676 aa  58.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  22.71 
 
 		 758 aa  56.6  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  27.23 
 
 		 700 aa  55.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  19.23 
 
 		 626 aa  54.3  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  26.54 
 
 		 662 aa  53.9  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  24.12 
 
 		 433 aa  52.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  20.36 
 
 		 627 aa  52.4  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  26.35 
 
 		 446 aa  52  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  22.29 
 
 		 666 aa  51.6  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  21.55 
 
 		 578 aa  51.6  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  23.58 
 
 		 626 aa  51.6  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  21.98 
 
 		 623 aa  51.2  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  22.63 
 
 		 891 aa  50.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  37.21 
 
 		 577 aa  50.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  23.5 
 
 		 604 aa  50.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  24.84 
 
 		 608 aa  48.9  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  20.31 
 
 		 648 aa  48.5  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  22.89 
 
 		 605 aa  48.1  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  19.28 
 
 		 629 aa  48.1  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  23.34 
 
 		 589 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  29.29 
 
 		 404 aa  46.6  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  23.12 
 
 		 607 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  27.82 
 
 		 578 aa  46.6  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  21.3 
 
 		 653 aa  45.4  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  33.9 
 
 		 623 aa  45.1  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  22.84 
 
 		 635 aa  45.1  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  21.85 
 
 		 649 aa  44.7  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 313 aa  44.3  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>