50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0629 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  100 
 
 
645 aa  1313    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  25.06 
 
 
1179 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  26.07 
 
 
700 aa  85.9  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  25.54 
 
 
702 aa  84.7  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  26.59 
 
 
654 aa  73.9  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  24.13 
 
 
617 aa  71.6  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  21.77 
 
 
649 aa  68.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  23.77 
 
 
635 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  22.45 
 
 
616 aa  65.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  26.01 
 
 
676 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  22.67 
 
 
629 aa  65.5  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  25.52 
 
 
578 aa  62.4  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  24.37 
 
 
673 aa  60.8  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  22.96 
 
 
653 aa  58.2  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  24.39 
 
 
647 aa  57.4  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  30.9 
 
 
470 aa  57.4  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  24.56 
 
 
604 aa  56.2  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  25.78 
 
 
629 aa  56.2  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  27.78 
 
 
618 aa  54.7  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  28.48 
 
 
812 aa  53.9  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  28.07 
 
 
570 aa  53.5  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  21.54 
 
 
891 aa  52.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  25.35 
 
 
638 aa  52.8  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  23.29 
 
 
446 aa  53.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 
826 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  23.76 
 
 
632 aa  52.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  25 
 
 
661 aa  51.6  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  22.15 
 
 
625 aa  51.2  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  20.9 
 
 
837 aa  51.2  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  22.77 
 
 
821 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2415  hypothetical protein  23.9 
 
 
656 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.174354  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  25.7 
 
 
825 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  23.98 
 
 
671 aa  49.7  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  21.53 
 
 
638 aa  48.9  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  24.46 
 
 
509 aa  48.5  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  24.73 
 
 
627 aa  48.1  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  25.52 
 
 
666 aa  47.4  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  25.47 
 
 
820 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  25.29 
 
 
442 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  25.29 
 
 
442 aa  47.4  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  26.15 
 
 
826 aa  47.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 
822 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  26.79 
 
 
626 aa  47.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  24.24 
 
 
833 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  22.08 
 
 
608 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  22.4 
 
 
578 aa  46.2  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  25.31 
 
 
435 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  25.31 
 
 
435 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  21.97 
 
 
824 aa  44.3  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  22.92 
 
 
822 aa  43.9  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>