66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1145 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  916    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  36.24 
 
 
441 aa  276  7e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  34.51 
 
 
431 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  35.53 
 
 
431 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  36.16 
 
 
442 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  36.89 
 
 
430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  35.7 
 
 
442 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  36.43 
 
 
430 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  33.1 
 
 
429 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  33.73 
 
 
435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  33.73 
 
 
435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  33.88 
 
 
433 aa  240  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  25.34 
 
 
440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  28.86 
 
 
616 aa  82  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  27.19 
 
 
821 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  26.79 
 
 
833 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  26.46 
 
 
841 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  26.81 
 
 
823 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  27.35 
 
 
629 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  28.07 
 
 
812 aa  67.8  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  29.13 
 
 
871 aa  67  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  25.75 
 
 
570 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  22.11 
 
 
635 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  23.93 
 
 
629 aa  63.2  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  21.95 
 
 
470 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  23.53 
 
 
638 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  31.14 
 
 
825 aa  62.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  22.84 
 
 
758 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  24.72 
 
 
626 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
839 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  25.9 
 
 
841 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
826 aa  57.4  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  22.69 
 
 
578 aa  57.4  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  22.78 
 
 
653 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  25.54 
 
 
824 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  24.05 
 
 
607 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  20.32 
 
 
617 aa  55.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  23.93 
 
 
826 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  22.22 
 
 
647 aa  54.3  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  22.96 
 
 
666 aa  54.3  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  20.53 
 
 
577 aa  53.5  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  24.71 
 
 
820 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  23.53 
 
 
605 aa  53.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  23.29 
 
 
645 aa  53.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  21.43 
 
 
625 aa  52.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  25.51 
 
 
605 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  20.69 
 
 
604 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  27.88 
 
 
661 aa  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  26.35 
 
 
822 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  25.11 
 
 
673 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 
822 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  26.11 
 
 
891 aa  50.4  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  30.67 
 
 
244 aa  50.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  24.3 
 
 
618 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  24.84 
 
 
578 aa  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  22.53 
 
 
649 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  20.46 
 
 
626 aa  46.6  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  22.13 
 
 
671 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  27.06 
 
 
837 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  18.85 
 
 
638 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  23.4 
 
 
648 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  24.78 
 
 
676 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  25.54 
 
 
662 aa  44.3  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  34.62 
 
 
238 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1600  hypothetical protein  33.33 
 
 
238 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  25.13 
 
 
589 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>