59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1335 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  70.7 
 
 
626 aa  865    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  100 
 
 
604 aa  1222    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  51.42 
 
 
578 aa  520  1e-146  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  48.16 
 
 
654 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  46.76 
 
 
625 aa  427  1e-118  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  47.56 
 
 
649 aa  424  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  46.65 
 
 
653 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  44.02 
 
 
638 aa  421  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  43.18 
 
 
638 aa  419  1e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  50.58 
 
 
629 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  48.9 
 
 
635 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  46.14 
 
 
632 aa  412  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  46.3 
 
 
647 aa  412  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  38.01 
 
 
661 aa  370  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  42.46 
 
 
617 aa  356  7.999999999999999e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  40.65 
 
 
666 aa  349  8e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  33.52 
 
 
627 aa  298  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  38.04 
 
 
605 aa  264  3e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  34.27 
 
 
605 aa  256  8e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  37.78 
 
 
607 aa  256  9e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  34.34 
 
 
605 aa  246  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  35.51 
 
 
608 aa  234  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  33.7 
 
 
570 aa  178  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  29.73 
 
 
671 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  27.32 
 
 
618 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  28.05 
 
 
891 aa  96.7  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  26.57 
 
 
616 aa  94.7  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  25.29 
 
 
629 aa  93.2  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  29.88 
 
 
470 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  24.27 
 
 
700 aa  69.7  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  28.36 
 
 
623 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  26.27 
 
 
821 aa  65.1  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  30.49 
 
 
676 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  24.26 
 
 
507 aa  61.2  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01241  hypothetical protein  24.12 
 
 
671 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.730155 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  25 
 
 
648 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  25.88 
 
 
823 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  22.77 
 
 
430 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  22.66 
 
 
826 aa  58.9  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  18.9 
 
 
589 aa  58.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  28.98 
 
 
578 aa  55.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  24.56 
 
 
645 aa  56.2  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  22.92 
 
 
430 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  22.11 
 
 
841 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2415  hypothetical protein  22.2 
 
 
656 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.174354  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  24.34 
 
 
662 aa  54.7  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  22.65 
 
 
758 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  24.76 
 
 
673 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  20.69 
 
 
446 aa  52  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  23.32 
 
 
825 aa  51.6  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  20.24 
 
 
839 aa  50.4  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  23.5 
 
 
822 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  22.74 
 
 
1179 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  23.08 
 
 
824 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 
826 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 
826 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  19.08 
 
 
626 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  22.6 
 
 
702 aa  47  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  34.43 
 
 
509 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>