59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0451 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  100 
 
 		 623 aa  1278    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  30.87 
 
 		 648 aa  232  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  29.19 
 
 		 629 aa  230  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  28.36 
 
 		 626 aa  161  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  26.46 
 
 		 616 aa  160  8e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  26.98 
 
 		 758 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  27.09 
 
 		 618 aa  144  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  29.14 
 
 		 470 aa  144  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  25.71 
 
 		 671 aa  124  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2415  hypothetical protein  23.18 
 
 		 656 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.174354  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  29.81 
 
 		 578 aa  108  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  23.97 
 
 		 891 aa  83.2  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  24.2 
 
 		 632 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  23.04 
 
 		 666 aa  80.5  0.00000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  23.57 
 
 		 638 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  23.24 
 
 		 649 aa  77  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  20.75 
 
 		 589 aa  75.5  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  26.16 
 
 		 627 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  28.09 
 
 		 607 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  23.91 
 
 		 653 aa  69.7  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  24.22 
 
 		 647 aa  68.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  22.59 
 
 		 635 aa  68.6  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  22.15 
 
 		 629 aa  67.8  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  26.88 
 
 		 833 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  28.36 
 
 		 604 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  23.21 
 
 		 578 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  26.72 
 
 		 605 aa  65.5  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  26.51 
 
 		 605 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  28.76 
 
 		 638 aa  64.7  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  23.06 
 
 		 661 aa  64.3  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 839 aa  63.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  22.17 
 
 		 626 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  22.94 
 
 		 812 aa  62.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  24.38 
 
 		 826 aa  62.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  28.03 
 
 		 605 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  24.22 
 
 		 837 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  20.89 
 
 		 826 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  20.89 
 
 		 826 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  23.55 
 
 		 507 aa  57  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  25.77 
 
 		 841 aa  57  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  20.4 
 
 		 577 aa  55.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  20.22 
 
 		 1179 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1044  protein of unknown function DUF115  20.64 
 
 		 560 aa  55.5  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  22.55 
 
 		 654 aa  55.1  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  26.72 
 
 		 617 aa  54.7  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  23.53 
 
 		 841 aa  54.3  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  23.47 
 
 		 821 aa  53.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  22.22 
 
 		 430 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  21.98 
 
 		 822 aa  51.2  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  25.1 
 
 		 608 aa  50.4  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  24.19 
 
 		 833 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  21.01 
 
 		 825 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  23.84 
 
 		 442 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  23.84 
 
 		 442 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  22.12 
 
 		 431 aa  48.9  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  21.52 
 
 		 700 aa  47  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  21.31 
 
 		 824 aa  47  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  23.17 
 
 		 625 aa  46.2  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  23.39 
 
 		 441 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>