58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3124 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
826 aa  1708    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
826 aa  1708    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  32.23 
 
 
837 aa  435  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  33.45 
 
 
841 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
839 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  31.38 
 
 
826 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  31.67 
 
 
841 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  30.61 
 
 
833 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  29.38 
 
 
822 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  30.41 
 
 
823 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  30.85 
 
 
833 aa  385  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 
826 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  29.71 
 
 
821 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  28.4 
 
 
820 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  28.48 
 
 
825 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
822 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  27.68 
 
 
824 aa  350  6e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  26.7 
 
 
871 aa  257  7e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  25.28 
 
 
812 aa  246  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  29.37 
 
 
618 aa  81.3  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  23.15 
 
 
629 aa  78.6  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  26.72 
 
 
470 aa  67.4  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  25.96 
 
 
626 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  25.45 
 
 
578 aa  65.5  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  23.85 
 
 
605 aa  62  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  28.76 
 
 
440 aa  61.2  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  20.89 
 
 
623 aa  58.5  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  27 
 
 
430 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  24.54 
 
 
616 aa  55.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  24.59 
 
 
430 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  20.62 
 
 
671 aa  55.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  26.05 
 
 
700 aa  55.1  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  25 
 
 
607 aa  54.7  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  24.83 
 
 
577 aa  54.7  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  25.41 
 
 
605 aa  54.7  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  24.53 
 
 
435 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  24.53 
 
 
435 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  25.75 
 
 
629 aa  53.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  23 
 
 
666 aa  53.1  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  26.01 
 
 
662 aa  52.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  21.9 
 
 
605 aa  51.6  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  24.07 
 
 
632 aa  51.6  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  22.67 
 
 
661 aa  50.1  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  23.62 
 
 
604 aa  48.9  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  24.45 
 
 
431 aa  48.1  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  22.68 
 
 
635 aa  47.8  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  21.5 
 
 
608 aa  46.6  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  21.28 
 
 
702 aa  45.4  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  23.19 
 
 
627 aa  45.4  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  24.57 
 
 
647 aa  45.8  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  22.27 
 
 
648 aa  45.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  26.84 
 
 
638 aa  45.4  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  26.2 
 
 
649 aa  45.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  25.54 
 
 
654 aa  44.3  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  26.61 
 
 
577 aa  44.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  24.35 
 
 
433 aa  44.3  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  21.4 
 
 
429 aa  44.3  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  25 
 
 
570 aa  44.3  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>