55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2228 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  100 
 
 
627 aa  1295    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  35.89 
 
 
666 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  34.35 
 
 
661 aa  352  8.999999999999999e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  34.89 
 
 
649 aa  302  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  33.52 
 
 
604 aa  298  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  32 
 
 
653 aa  291  3e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  32.38 
 
 
626 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  37.26 
 
 
635 aa  281  3e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  38.52 
 
 
632 aa  279  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  36.53 
 
 
578 aa  277  4e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  35.85 
 
 
629 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  33.81 
 
 
638 aa  274  3e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  31.58 
 
 
638 aa  265  2e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  32.92 
 
 
625 aa  258  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  31.26 
 
 
647 aa  256  9e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  30.85 
 
 
654 aa  248  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  30.77 
 
 
617 aa  234  3e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  29.5 
 
 
605 aa  184  6e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  29.12 
 
 
607 aa  180  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  28.35 
 
 
605 aa  175  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  29.29 
 
 
605 aa  168  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  29.75 
 
 
608 aa  165  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  28.19 
 
 
570 aa  144  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  27.65 
 
 
671 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  25.06 
 
 
618 aa  103  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  26.6 
 
 
629 aa  92.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  26.27 
 
 
891 aa  87.8  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  23.92 
 
 
616 aa  79  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  26.16 
 
 
623 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  24.3 
 
 
430 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  21.77 
 
 
826 aa  60.5  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  20.25 
 
 
648 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  22.53 
 
 
626 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  22.44 
 
 
823 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  26.06 
 
 
841 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  25 
 
 
821 aa  55.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  23.3 
 
 
507 aa  54.7  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  22.48 
 
 
702 aa  53.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  20.36 
 
 
822 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  26.69 
 
 
470 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  23.19 
 
 
700 aa  50.4  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  21.6 
 
 
578 aa  49.3  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  21.73 
 
 
758 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  24.73 
 
 
645 aa  48.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  20.9 
 
 
825 aa  47.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 
826 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  24.14 
 
 
837 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  19.88 
 
 
824 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  22.05 
 
 
589 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 
826 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 
826 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  20.58 
 
 
871 aa  45.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  24.52 
 
 
833 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  22.83 
 
 
1179 aa  44.3  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  23.46 
 
 
841 aa  43.9  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>