68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1457 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  1029    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  28.13 
 
 
618 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  24.94 
 
 
616 aa  103  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  22.08 
 
 
626 aa  97.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  26.67 
 
 
578 aa  97.1  8e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  22.41 
 
 
629 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  27.74 
 
 
617 aa  91.3  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  24.42 
 
 
649 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  27.24 
 
 
758 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  24.81 
 
 
653 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  23.92 
 
 
577 aa  75.9  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  29.21 
 
 
824 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  23.85 
 
 
647 aa  71.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  25.85 
 
 
648 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  24.68 
 
 
607 aa  70.9  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  28.26 
 
 
570 aa  70.5  0.00000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  23.76 
 
 
604 aa  70.1  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  23.68 
 
 
654 aa  70.1  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  22.65 
 
 
632 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  25.06 
 
 
638 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  23.18 
 
 
635 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  22.37 
 
 
638 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  23.08 
 
 
629 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  24.03 
 
 
605 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  26.22 
 
 
823 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  26.63 
 
 
605 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  23.23 
 
 
470 aa  64.3  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2525  hypothetical protein  28.17 
 
 
582 aa  63.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 
826 aa  62.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  27.18 
 
 
605 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  25.5 
 
 
837 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  23.75 
 
 
700 aa  62  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  28.93 
 
 
812 aa  61.2  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1044  protein of unknown function DUF115  22.89 
 
 
560 aa  60.5  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  23.89 
 
 
578 aa  60.5  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  25.43 
 
 
821 aa  60.1  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  28.09 
 
 
841 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  23.33 
 
 
627 aa  59.3  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  22.66 
 
 
623 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
839 aa  57.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  24.93 
 
 
625 aa  57.4  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  27.39 
 
 
430 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  26.55 
 
 
871 aa  56.2  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1458  hypothetical protein  23.68 
 
 
509 aa  55.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  22.49 
 
 
509 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  22.36 
 
 
626 aa  54.7  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  24.06 
 
 
431 aa  54.7  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  23.74 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  25.2 
 
 
430 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  22.43 
 
 
608 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  22.28 
 
 
666 aa  50.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  25 
 
 
826 aa  50.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  23.98 
 
 
442 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  27.22 
 
 
435 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  27.22 
 
 
435 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  24.74 
 
 
825 aa  49.7  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  27.71 
 
 
433 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  24.93 
 
 
429 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  23.69 
 
 
833 aa  48.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  21.66 
 
 
661 aa  47.8  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  26.55 
 
 
244 aa  47  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
822 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  25.23 
 
 
820 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  25.62 
 
 
676 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  35.38 
 
 
1179 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  26.09 
 
 
431 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01241  hypothetical protein  25 
 
 
671 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.730155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2415  hypothetical protein  21.52 
 
 
656 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.174354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>