73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1285 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  46.26 
 
 		 826 aa  717    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  100 
 
 		 824 aa  1690    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  41.18 
 
 		 820 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  40.58 
 
 		 822 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 		 822 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  40.19 
 
 		 823 aa  579  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  39.64 
 
 		 821 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  37.78 
 
 		 841 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  38.73 
 
 		 833 aa  562  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  35.07 
 
 		 825 aa  484  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  34.22 
 
 		 826 aa  480  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 826 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 826 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  26.77 
 
 		 841 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 839 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  26.09 
 
 		 837 aa  303  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  26.21 
 
 		 833 aa  276  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  23.89 
 
 		 871 aa  188  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  26.49 
 
 		 812 aa  185  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  26.41 
 
 		 618 aa  78.6  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  25.08 
 
 		 700 aa  73.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  29.21 
 
 		 507 aa  70.9  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  26.22 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  25.71 
 
 		 578 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  22.27 
 
 		 629 aa  65.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  29.44 
 
 		 638 aa  59.3  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  25.15 
 
 		 616 aa  58.9  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  23.64 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  26.5 
 
 		 649 aa  58.2  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1179 aa  58.2  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  28.24 
 
 		 662 aa  57.8  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  23.44 
 
 		 431 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  22.65 
 
 		 578 aa  57  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  26.11 
 
 		 676 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  21.72 
 
 		 441 aa  56.6  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  22.77 
 
 		 430 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  22.71 
 
 		 429 aa  57  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  25.54 
 
 		 446 aa  55.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  25 
 
 		 671 aa  55.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  27.39 
 
 		 635 aa  54.7  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  25.15 
 
 		 673 aa  54.7  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  24.55 
 
 		 629 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  22.47 
 
 		 570 aa  53.9  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  24.76 
 
 		 632 aa  52.8  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  23.68 
 
 		 638 aa  52.4  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  23.62 
 
 		 431 aa  52.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  25.58 
 
 		 577 aa  51.2  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  22.73 
 
 		 702 aa  50.8  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  22.3 
 
 		 433 aa  50.8  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  21.71 
 
 		 605 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  22.38 
 
 		 661 aa  49.7  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  23.08 
 
 		 442 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  23.08 
 
 		 442 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1660  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.16 
 
 		 370 aa  49.3  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  24.54 
 
 		 605 aa  49.3  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  27.47 
 
 		 440 aa  49.3  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  23.08 
 
 		 604 aa  48.9  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  17.88 
 
 		 589 aa  48.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  22.32 
 
 		 605 aa  47.8  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.02 
 
 		 616 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 615 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  22.52 
 
 		 607 aa  47.8  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  24.62 
 
 		 238 aa  47.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  21.31 
 
 		 623 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  22.82 
 
 		 648 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01241  hypothetical protein  25.68 
 
 		 671 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.730155 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2525  hypothetical protein  23.32 
 
 		 582 aa  46.2  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  19.88 
 
 		 627 aa  46.2  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4766  hypothetical protein  26.7 
 
 		 285 aa  45.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  23.42 
 
 		 666 aa  45.4  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  23.7 
 
 		 647 aa  45.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  22.46 
 
 		 653 aa  44.7  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  21.97 
 
 		 645 aa  44.3  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>