80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_17040 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  100 
 
 
618 aa  1268    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  31.75 
 
 
629 aa  248  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  30.36 
 
 
648 aa  218  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  27.41 
 
 
671 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  28.17 
 
 
616 aa  162  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  26.99 
 
 
470 aa  160  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  27.09 
 
 
623 aa  144  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  28.05 
 
 
578 aa  137  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  24.79 
 
 
626 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  28.54 
 
 
632 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  26.68 
 
 
649 aa  115  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  29.11 
 
 
578 aa  114  6e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  25.74 
 
 
653 aa  114  6e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  27 
 
 
635 aa  114  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  29.18 
 
 
626 aa  113  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  26.29 
 
 
617 aa  111  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  26.77 
 
 
654 aa  110  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  27.85 
 
 
629 aa  109  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  28.24 
 
 
638 aa  108  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  27.32 
 
 
604 aa  106  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  27.63 
 
 
661 aa  105  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  24.47 
 
 
758 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  25.06 
 
 
627 aa  103  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  25.39 
 
 
607 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  24.09 
 
 
647 aa  101  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  24.75 
 
 
605 aa  100  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  24.8 
 
 
605 aa  100  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  23.98 
 
 
638 aa  100  9e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  25.98 
 
 
666 aa  98.2  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  24.08 
 
 
625 aa  97.8  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  28.62 
 
 
605 aa  97.1  8e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  26.51 
 
 
577 aa  96.3  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  27.96 
 
 
507 aa  94  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  25.11 
 
 
891 aa  92.8  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  25.5 
 
 
570 aa  90.5  8e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  28.14 
 
 
821 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2415  hypothetical protein  21.13 
 
 
656 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.174354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  25.13 
 
 
700 aa  82  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  24.63 
 
 
608 aa  81.6  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
826 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
826 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  30.3 
 
 
435 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  26.41 
 
 
824 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  30.3 
 
 
435 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  29.46 
 
 
812 aa  77  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 
826 aa  77  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  24.23 
 
 
823 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  22.84 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  25.27 
 
 
822 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  24.35 
 
 
820 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  24.56 
 
 
702 aa  72.8  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  22.96 
 
 
431 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  23.86 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  25.93 
 
 
833 aa  70.9  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  24.72 
 
 
442 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 
822 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  17.84 
 
 
589 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  25.28 
 
 
442 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  26.87 
 
 
841 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  25.29 
 
 
841 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 
839 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  21.14 
 
 
1179 aa  65.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  25 
 
 
833 aa  65.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  25.22 
 
 
826 aa  65.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  22.99 
 
 
430 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  25.29 
 
 
837 aa  64.7  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  25.69 
 
 
429 aa  63.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  25 
 
 
825 aa  62.4  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  27.2 
 
 
433 aa  62  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2525  hypothetical protein  23.21 
 
 
582 aa  61.2  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  26.29 
 
 
431 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3024  hypothetical protein  37.63 
 
 
638 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1044  protein of unknown function DUF115  24.23 
 
 
560 aa  57.8  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  27.78 
 
 
645 aa  54.7  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  23.21 
 
 
871 aa  53.5  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  22.98 
 
 
509 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  24.56 
 
 
440 aa  50.8  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  24.3 
 
 
446 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  29.52 
 
 
662 aa  50.4  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01241  hypothetical protein  22.59 
 
 
671 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.730155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>