47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1336 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  60.79 
 
 
649 aa  756    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  64.62 
 
 
653 aa  829    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  63.54 
 
 
638 aa  806    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  62.15 
 
 
647 aa  771    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  100 
 
 
654 aa  1316    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  47.69 
 
 
638 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  46.3 
 
 
635 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  45.33 
 
 
629 aa  491  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  45.84 
 
 
625 aa  456  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  43.93 
 
 
632 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  48.64 
 
 
604 aa  437  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  49.44 
 
 
626 aa  438  1e-121  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  41.33 
 
 
617 aa  435  1e-120  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  36.85 
 
 
666 aa  333  6e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  33.98 
 
 
661 aa  323  5e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  43.84 
 
 
578 aa  312  2e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  30.85 
 
 
627 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  33.45 
 
 
605 aa  220  5e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  32.46 
 
 
605 aa  221  5e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  30.8 
 
 
607 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  31.12 
 
 
605 aa  209  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  33.13 
 
 
608 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  30.82 
 
 
570 aa  146  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  29.48 
 
 
671 aa  125  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  27.58 
 
 
618 aa  120  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  23.71 
 
 
891 aa  85.9  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  28.1 
 
 
645 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  25.35 
 
 
616 aa  75.1  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  24.14 
 
 
507 aa  72.8  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  32.28 
 
 
470 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  21.95 
 
 
629 aa  70.5  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  22.71 
 
 
623 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  22.84 
 
 
758 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  25.32 
 
 
509 aa  54.7  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  25.31 
 
 
648 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  18.64 
 
 
589 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  26.99 
 
 
676 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01241  hypothetical protein  22.09 
 
 
671 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.730155 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  25.11 
 
 
700 aa  50.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  26.13 
 
 
662 aa  49.3  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  25.88 
 
 
673 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  20.26 
 
 
1179 aa  48.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  23.38 
 
 
430 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  21.09 
 
 
626 aa  47.4  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  25.68 
 
 
578 aa  46.6  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
826 aa  43.9  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
826 aa  43.9  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>