72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0162 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  100 
 
 		 570 aa  1145    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  38.71 
 
 		 607 aa  286  7e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  39.91 
 
 		 608 aa  284  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  37.62 
 
 		 605 aa  279  8e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  37.2 
 
 		 605 aa  278  2e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  35.9 
 
 		 605 aa  274  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  31.26 
 
 		 617 aa  192  2e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  34.1 
 
 		 625 aa  181  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  33.56 
 
 		 578 aa  180  4.999999999999999e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  33.7 
 
 		 604 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  30.93 
 
 		 649 aa  177  5e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  33.25 
 
 		 626 aa  170  6e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  29.67 
 
 		 653 aa  169  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  30.33 
 
 		 629 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  29.73 
 
 		 661 aa  159  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  30.73 
 
 		 632 aa  157  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  29.27 
 
 		 635 aa  155  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  30.97 
 
 		 638 aa  153  8e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  30.48 
 
 		 638 aa  153  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  29.03 
 
 		 647 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  30.19 
 
 		 666 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  28.19 
 
 		 627 aa  144  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1336  PseD  30.28 
 
 		 654 aa  144  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  24.74 
 
 		 616 aa  92  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  25.5 
 
 		 618 aa  90.5  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  28.24 
 
 		 671 aa  89.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  28.63 
 
 		 662 aa  81.3  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  24.28 
 
 		 891 aa  80.5  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  29.2 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  23.26 
 
 		 758 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  23.71 
 
 		 629 aa  66.6  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  25.75 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  22.05 
 
 		 430 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  25 
 
 		 822 aa  62.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 822 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  22.56 
 
 		 821 aa  62.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  24.39 
 
 		 820 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  23.63 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  28.26 
 
 		 507 aa  61.2  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  28.2 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  25.22 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  26.71 
 
 		 435 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  27.67 
 
 		 833 aa  60.1  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  24.36 
 
 		 626 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  26.71 
 
 		 435 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  23.05 
 
 		 825 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  22.91 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  23.96 
 
 		 823 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  26.24 
 
 		 578 aa  57  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  37.7 
 
 		 812 aa  57  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  23.74 
 
 		 826 aa  56.6  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  24.31 
 
 		 841 aa  57  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  25.42 
 
 		 648 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  26.3 
 
 		 442 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  26.3 
 
 		 442 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  25.2 
 
 		 431 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  22.47 
 
 		 824 aa  53.9  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0629  protein of unknown function DUF115  28.07 
 
 		 645 aa  53.5  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822878  hitchhiker  0.000000292404 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  24.47 
 
 		 871 aa  53.5  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  26.67 
 
 		 577 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  21.05 
 
 		 700 aa  50.4  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  50 
 
 		 673 aa  50.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  25.83 
 
 		 440 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  22.68 
 
 		 429 aa  49.7  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  23.08 
 
 		 509 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  24.26 
 
 		 837 aa  48.5  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1179 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  34.12 
 
 		 244 aa  46.2  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2525  hypothetical protein  36.49 
 
 		 582 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  28.03 
 
 		 676 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 826 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 826 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>