68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3107 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  43.23 
 
 		 823 aa  675    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  46.08 
 
 		 821 aa  720    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  44.44 
 
 		 820 aa  716    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  100 
 
 		 841 aa  1729    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  68.75 
 
 		 833 aa  1197    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  44.31 
 
 		 822 aa  694    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  44.63 
 
 		 822 aa  702    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  41.09 
 
 		 826 aa  621  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  38.24 
 
 		 825 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  38.2 
 
 		 826 aa  587  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  37.78 
 
 		 824 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  31.83 
 
 		 841 aa  412  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 826 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 826 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 839 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  28.62 
 
 		 837 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  27.53 
 
 		 833 aa  300  8e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  26.22 
 
 		 812 aa  244  6e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  25.46 
 
 		 871 aa  221  3.9999999999999997e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  29.38 
 
 		 629 aa  76.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  26.46 
 
 		 446 aa  72  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  26.91 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  29.63 
 
 		 616 aa  70.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  27.71 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  27.71 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  30.05 
 
 		 700 aa  67.4  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  26.87 
 
 		 618 aa  67  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  25.45 
 
 		 430 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  26.49 
 
 		 578 aa  63.9  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  23.08 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  25 
 
 		 673 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  26.69 
 
 		 431 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  27.95 
 
 		 662 aa  59.3  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  28.26 
 
 		 578 aa  59.3  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  26.42 
 
 		 577 aa  58.9  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  24.19 
 
 		 661 aa  58.2  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  23.74 
 
 		 442 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  25.77 
 
 		 623 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  25.85 
 
 		 470 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  24.31 
 
 		 570 aa  57  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  23.74 
 
 		 442 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  26.42 
 
 		 891 aa  55.1  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  25.58 
 
 		 671 aa  55.1  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  25.11 
 
 		 649 aa  54.3  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  22.18 
 
 		 666 aa  54.3  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  27.85 
 
 		 626 aa  54.3  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  25.45 
 
 		 608 aa  53.5  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  25.3 
 
 		 648 aa  52.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  26.29 
 
 		 625 aa  52  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  26.23 
 
 		 605 aa  52  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  23.31 
 
 		 440 aa  52  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  27.11 
 
 		 607 aa  52  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  22.32 
 
 		 638 aa  51.6  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  26.7 
 
 		 676 aa  51.2  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  25.95 
 
 		 605 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1179 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  33.04 
 
 		 623 aa  50.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  25.15 
 
 		 635 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  21.86 
 
 		 441 aa  48.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  26.44 
 
 		 605 aa  48.1  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  23.89 
 
 		 632 aa  48.1  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  27.62 
 
 		 629 aa  48.1  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  23.08 
 
 		 702 aa  47.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  21.69 
 
 		 758 aa  46.2  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  22.32 
 
 		 431 aa  45.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 313 aa  45.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  27.69 
 
 		 238 aa  45.1  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  22.7 
 
 		 653 aa  44.7  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>