53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1028 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0314  hypothetical protein  91.18 
 
 		 238 aa  443  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1600  hypothetical protein  89.92 
 
 		 238 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  71.55 
 
 		 239 aa  347  7e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0458  hypothetical protein  61 
 
 		 242 aa  301  7.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3612  hypothetical protein  47.67 
 
 		 213 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0184  hypothetical protein  40.71 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000950206  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  48.73 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0624  hypothetical protein  36.96 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0659774  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2645  protein of unknown function DUF115  35.9 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316765  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0755  hypothetical protein  39.47 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.236043  normal  0.782372 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0215  protein of unknown function DUF115  42.72 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0615  hypothetical protein  34.92 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.835351  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0147  protein of unknown function DUF115  33.33 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00922435 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0003  protein of unknown function DUF115  30.6 
 
 		 232 aa  111  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.115693  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1187  protein of unknown function DUF115  34.63 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2770  protein of unknown function DUF115  31.28 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00349499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0624  hypothetical protein  37.43 
 
 		 162 aa  99.4  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.24895 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1845  protein of unknown function DUF115  30.4 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1388  protein of unknown function DUF115  30.32 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.228994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0398  hypothetical protein  31.75 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.176265  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1969  hypothetical protein  36.55 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.628894 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1542  hypothetical protein  35.21 
 
 		 201 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.034899 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1670  hypothetical protein  34.62 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000666865 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1041  hypothetical protein  35.65 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.775077  hitchhiker  0.000191515 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1475  hypothetical protein  29.79 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.430419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  35.11 
 
 		 431 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  43.08 
 
 		 371 aa  49.7  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  26.35 
 
 		 396 aa  49.3  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  24.62 
 
 		 824 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  27.7 
 
 		 395 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  27.09 
 
 		 433 aa  45.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  29.53 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  25.68 
 
 		 389 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  27.69 
 
 		 841 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  34.62 
 
 		 446 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  25.85 
 
 		 365 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  29.86 
 
 		 635 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  36.36 
 
 		 435 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  36.36 
 
 		 435 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  27.62 
 
 		 820 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  27.91 
 
 		 578 aa  43.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  27.45 
 
 		 399 aa  43.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 826 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  28.39 
 
 		 430 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  26.32 
 
 		 395 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  30.07 
 
 		 442 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  26.14 
 
 		 647 aa  42.7  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  30.07 
 
 		 442 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  28.57 
 
 		 676 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  30.59 
 
 		 440 aa  42  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>