29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0636 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0636  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  636    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1940  hypothetical protein  55.08 
 
 
331 aa  355  5e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5778  hypothetical protein  30.51 
 
 
618 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.350966 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6422  hypothetical protein  25.95 
 
 
609 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297493  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3682  hypothetical protein  27.03 
 
 
623 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.33517  normal  0.702936 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1137  hypothetical protein  36.73 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6226  hypothetical protein  23.43 
 
 
613 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.08261 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  25 
 
 
1049 aa  52.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3202  spore maturation protein cgeB, putative  36.9 
 
 
331 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5736  hypothetical protein  23.47 
 
 
330 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66120  hypothetical protein  23.71 
 
 
318 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2891  spore maturation CgeB protein  32.93 
 
 
331 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3195  spore maturation protein  32.93 
 
 
331 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2955  spore maturation protein  32.93 
 
 
331 aa  46.2  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000526439  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
1162 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1502  hypothetical protein  25.34 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0246956  normal  0.685682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3207  spore maturation protein  31.71 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0780  spore maturation protein CgeB, putative  24.14 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258431  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4989  hypothetical protein  24.17 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0528  hypothetical protein  24.35 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0728399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4940  hypothetical protein  24.17 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4812  hypothetical protein  24.17 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  23.91 
 
 
673 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1165  CgeB family protein  27.27 
 
 
394 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4988  hypothetical protein  24 
 
 
318 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0033  spore maturation protein  47.73 
 
 
325 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3201  CgeB family protein  30.28 
 
 
395 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2183  cgeB protein  47.73 
 
 
325 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000081771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0532  hypothetical protein  24.57 
 
 
318 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>