13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0532 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0532  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  658    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4988  hypothetical protein  94.34 
 
 
318 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4940  hypothetical protein  78.55 
 
 
318 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4812  hypothetical protein  78.55 
 
 
318 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4989  hypothetical protein  78.23 
 
 
318 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0528  hypothetical protein  77.29 
 
 
318 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0728399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5736  hypothetical protein  76.77 
 
 
330 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66120  hypothetical protein  76.21 
 
 
318 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0627  hypothetical protein  30.71 
 
 
426 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
399 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
399 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 
409 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0636  hypothetical protein  24.57 
 
 
308 aa  42.4  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>