More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1759 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1759  elongation factor Tu domain-containing protein  100 
 
 
309 aa  621  1e-177  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.176944  normal  0.07241 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0147  elongation factor Tu domain-containing protein  96.12 
 
 
309 aa  607  1e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0844  elongation factor Tu domain-containing protein  95.15 
 
 
309 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1608  elongation factor Tu domain-containing protein  81.43 
 
 
308 aa  528  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00210817  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1086  elongation factor Tu domain-containing protein  68.17 
 
 
311 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0939  hypothetical protein  36 
 
 
321 aa  203  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.531968  normal  0.0561005 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1398  elongation factor Tu domain-containing protein  34.92 
 
 
316 aa  203  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0881815  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0604  elongation factor Tu domain-containing protein  35.94 
 
 
321 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.516799  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2448  elongation factor Tu domain-containing protein  34.27 
 
 
322 aa  190  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2226  elongation factor Tu domain 2 protein  36.14 
 
 
317 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2296  elongation factor Tu domain-containing protein  33.96 
 
 
319 aa  186  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0961  elongation factor Tu domain-containing protein  34.81 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000731356 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1757  elongation factor Tu domain-containing protein  29.54 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.407028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0971  translation elongation factor  28.44 
 
 
356 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0776  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.97 
 
 
468 aa  93.6  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.839445  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0581  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.81 
 
 
468 aa  89.7  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.362807  normal  0.0518155 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  26.84 
 
 
634 aa  89.7  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0647  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.24 
 
 
468 aa  89  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.462706  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1337  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.16 
 
 
468 aa  86.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.811208  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0257  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  26.75 
 
 
468 aa  85.9  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.66 
 
 
634 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  24.61 
 
 
633 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.39 
 
 
655 aa  79.7  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.35 
 
 
644 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  26.3 
 
 
444 aa  76.3  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  26.13 
 
 
444 aa  76.3  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0832  translation elongation factor, selenocysteine-specific  23.96 
 
 
611 aa  75.9  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.5118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  22.6 
 
 
628 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0756  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.38 
 
 
606 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3075  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.16 
 
 
657 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.14 
 
 
643 aa  74.7  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  25.17 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  25.26 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6613  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.02 
 
 
648 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0913819 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1155  protein synthesis factor GTP-binding  26.47 
 
 
545 aa  73.2  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.18 
 
 
634 aa  73.2  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  22.74 
 
 
627 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3266  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.08 
 
 
643 aa  72  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.901802  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.53 
 
 
627 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  21.02 
 
 
637 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.16 
 
 
635 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2206  protein synthesis factor GTP-binding protein  29.61 
 
 
551 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0200  protein synthesis factor GTP-binding protein  29.78 
 
 
533 aa  69.7  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.54 
 
 
636 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.33 
 
 
631 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.54 
 
 
636 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.97 
 
 
635 aa  69.3  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  25.56 
 
 
423 aa  68.9  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  20.15 
 
 
636 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.59 
 
 
635 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.06 
 
 
642 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0070  protein synthesis factor GTP-binding  25.42 
 
 
540 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  26.11 
 
 
657 aa  67.8  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0073  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  27.91 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000421656  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.59 
 
 
635 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  20.42 
 
 
637 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1547  selenocysteine-specific translation elongation factor  24.28 
 
 
601 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  21.86 
 
 
637 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3332  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.99 
 
 
691 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.665581 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  26.32 
 
 
435 aa  67  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  25.12 
 
 
435 aa  67  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1813  protein synthesis factor GTP-binding  27.68 
 
 
557 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.133503  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.66 
 
 
657 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  20.42 
 
 
636 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  20.88 
 
 
636 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.04 
 
 
635 aa  65.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.91 
 
 
636 aa  65.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  26.46 
 
 
444 aa  65.9  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  21.65 
 
 
642 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  25.85 
 
 
421 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  23.94 
 
 
420 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.11 
 
 
650 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0596  elongation factor Tu  26.43 
 
 
394 aa  64.3  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00435785  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  21.05 
 
 
629 aa  64.7  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  21.76 
 
 
619 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.48 
 
 
641 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2391  translation elongation factor, selenocysteine-specific  22.48 
 
 
651 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451398  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2254  translation elongation factor, selenocysteine-specific  22.48 
 
 
651 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0725  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.48 
 
 
641 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1904  translation elongation factor, selenocysteine-specific  22.48 
 
 
651 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1697  translation elongation factor, selenocysteine-specific  22.48 
 
 
651 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1672  elongation factor Tu  25.52 
 
 
399 aa  63.2  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000990168  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0576  translation elongation factor, selenocysteine-specific  22.48 
 
 
651 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1452  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 
301 aa  63.2  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.43051  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0840  translation elongation factor Tu  24.87 
 
 
398 aa  63.2  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0541  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.66 
 
 
605 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00149249  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  23.02 
 
 
641 aa  62.4  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  20.65 
 
 
644 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0766  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.55 
 
 
605 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  25 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  25 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  22.87 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1963  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.73 
 
 
590 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.387563  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  25.78 
 
 
420 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5216  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  23.08 
 
 
565 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38745  predicted protein  27.41 
 
 
563 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0480092 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1101  translation elongation factor Tu  24.37 
 
 
398 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000113146  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5304  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  23.08 
 
 
565 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5596  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  22.65 
 
 
570 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1287  selenocysteine-specific elongation factor  22.57 
 
 
601 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>