More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1608 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1608  elongation factor Tu domain-containing protein  100 
 
 		 308 aa  620  1e-177  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00210817  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0147  elongation factor Tu domain-containing protein  80.78 
 
 		 309 aa  525  1e-148  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0844  elongation factor Tu domain-containing protein  82.08 
 
 		 309 aa  519  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1759  elongation factor Tu domain-containing protein  81.43 
 
 		 309 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.176944  normal  0.07241 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1086  elongation factor Tu domain-containing protein  63.99 
 
 		 311 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0604  elongation factor Tu domain-containing protein  38.36 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.516799  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0939  hypothetical protein  36.01 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.531968  normal  0.0561005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2296  elongation factor Tu domain-containing protein  35.8 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1398  elongation factor Tu domain-containing protein  32.59 
 
 		 316 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0881815  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2448  elongation factor Tu domain-containing protein  35.58 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2226  elongation factor Tu domain 2 protein  36.19 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0961  elongation factor Tu domain-containing protein  36.33 
 
 		 306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000731356 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1757  elongation factor Tu domain-containing protein  28.31 
 
 		 345 aa  119  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.407028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0971  translation elongation factor  30.06 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0776  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.03 
 
 		 468 aa  96.7  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.839445  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0581  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.31 
 
 		 468 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.362807  normal  0.0518155 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0647  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.13 
 
 		 468 aa  90.9  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.462706  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1337  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.73 
 
 		 468 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.811208  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0257  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  27.31 
 
 		 468 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3075  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.59 
 
 		 657 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0756  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.73 
 
 		 606 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  25.79 
 
 		 634 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3266  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.74 
 
 		 643 aa  76.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.901802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3261  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  27.8 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664199  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.31 
 
 		 655 aa  75.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0832  translation elongation factor, selenocysteine-specific  24.54 
 
 		 611 aa  75.9  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.5118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4266  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.95 
 
 		 634 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.14 
 
 		 644 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.05 
 
 		 634 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2548  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  21.88 
 
 		 637 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1693  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.76 
 
 		 643 aa  73.2  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.986647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6555  selenocysteine-specific translation elongation factor  21.05 
 
 		 637 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0281066  hitchhiker  0.00125424 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1362  elongation factor 1-alpha  24.42 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.91449  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0497  elongation factor 1-alpha  23.51 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4628  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  21.51 
 
 		 628 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1114  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.89 
 
 		 633 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.366063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2560  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.48 
 
 		 631 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.475206  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.91 
 
 		 650 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.91 
 
 		 636 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  24.29 
 
 		 636 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11400  selenocysteine-specific elongation factor SelB  27.27 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4523  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.84 
 
 		 646 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1731  elongation factor 1-alpha  24.71 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00222772 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.19 
 
 		 642 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.77 
 
 		 644 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.99 
 
 		 635 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1111  elongation factor 1-alpha  24.03 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.63 
 
 		 635 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1452  conserved hypothetical protein  28.16 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.43051  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  24.63 
 
 		 627 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0397  elongation factor 1-alpha  23.64 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209425  normal  0.0958678 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  21.58 
 
 		 636 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  21.68 
 
 		 629 aa  67.4  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.18 
 
 		 636 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.94 
 
 		 627 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0156  elongation factor 1-alpha  22.79 
 
 		 421 aa  67  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0041  elongation factor 1-alpha  28.65 
 
 		 435 aa  67  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000171412  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.06 
 
 		 636 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0832  selenocysteine-specific translation elongation factor  21.68 
 
 		 637 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4377  selenocysteine-specific translation elongation factor  21.69 
 
 		 641 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.574205  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1745  elongation factor 1-alpha  27.31 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3989  selenocysteine-specific translation elongation factor  21.69 
 
 		 641 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3539  selenocysteine-specific translation elongation factor  21.69 
 
 		 641 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  21.18 
 
 		 636 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.52 
 
 		 657 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3066  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  24.02 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2516  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  23.23 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  24.12 
 
 		 619 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2923  selenocysteine-specific translation elongation factor  28.23 
 
 		 650 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3332  selenocysteine-specific translation elongation factor  21.9 
 
 		 691 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.665581 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1196  translation elongation factor EF-1, subunit alpha  26.32 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8917  predicted protein  26.97 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0512895  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38745  predicted protein  28.08 
 
 		 563 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0480092 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0821  elongation factor 1-alpha  26.67 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0653  selenocysteine-specific translation elongation factor  23.66 
 
 		 636 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0190681  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2084  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.7 
 
 		 635 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4592  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.3 
 
 		 641 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0647  elongation factor 1-alpha  26.4 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000513743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6613  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.97 
 
 		 648 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0913819 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2372  selenocysteine-specific translation elongation factor  26.7 
 
 		 635 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0811  elongation factor 1-alpha  22.83 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0596  elongation factor Tu  26.75 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00435785  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  26.37 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  26.37 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  25.82 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2254  translation elongation factor, selenocysteine-specific  21 
 
 		 651 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  25.16 
 
 		 642 aa  62.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678  selenocysteine-specific translation elongation factor  20.58 
 
 		 641 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0725  selenocysteine-specific translation elongation factor  20.58 
 
 		 641 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0576  translation elongation factor, selenocysteine-specific  20.58 
 
 		 651 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1697  translation elongation factor, selenocysteine-specific  20.58 
 
 		 651 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1904  translation elongation factor, selenocysteine-specific  20.58 
 
 		 651 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2391  translation elongation factor, selenocysteine-specific  20.58 
 
 		 651 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451398  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0541  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.36 
 
 		 605 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00149249  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3884  selenocysteine-specific translation elongation factor  22.17 
 
 		 641 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0882754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  23.28 
 
 		 396 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2206  protein synthesis factor GTP-binding protein  28.02 
 
 		 551 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0200  protein synthesis factor GTP-binding protein  28.96 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25300  selenocysteine-specific elongation factor SelB  22.68 
 
 		 641 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1155  protein synthesis factor GTP-binding  27.81 
 
 		 545 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>