82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2064 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2064  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  100 
 
 		 457 aa  907    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174076 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0549  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  37.88 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.973361 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2215  hypothetical protein  37.91 
 
 		 459 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221067  normal  0.771798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2950  hypothetical protein  38.34 
 
 		 445 aa  249  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1250  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  35.71 
 
 		 445 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.05664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2784  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  34.67 
 
 		 446 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1803  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  36.14 
 
 		 459 aa  237  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3881  hypothetical protein  35.55 
 
 		 494 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2417  hypothetical protein  36.84 
 
 		 508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2176  putative TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component protein  35.98 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0798  hypothetical protein  35.09 
 
 		 497 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.375789 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0734  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  34.26 
 
 		 496 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0717  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  34.26 
 
 		 490 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482708  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3507  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  34.11 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0810  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  34.72 
 
 		 480 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1509  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  34.02 
 
 		 433 aa  226  6e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0355  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  34.72 
 
 		 520 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541877  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2606  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  34.52 
 
 		 445 aa  226  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.909099  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0838  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  34.72 
 
 		 480 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2546  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  35.95 
 
 		 475 aa  226  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.644539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1202  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  34.76 
 
 		 445 aa  226  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3930  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  34.03 
 
 		 480 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282648  normal  0.013766 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3645  putative TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component protein  35.25 
 
 		 451 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.746605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2081  putative TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component protein  36.3 
 
 		 450 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309573  normal  0.855747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14230  hypothetical protein  34.76 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11470  hypothetical protein  35.71 
 
 		 445 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0935266  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1418  hypothetical protein  34.14 
 
 		 444 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3203  hypothetical protein  34.26 
 
 		 499 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3187  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  34.26 
 
 		 499 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2718  hypothetical protein  34.26 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.929618  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1892  hypothetical protein  34.26 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1263  hypothetical protein  34.52 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236927  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0884  hypothetical protein  34.26 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2030  hypothetical protein  34.26 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.350637  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1255  hypothetical protein  32.95 
 
 		 446 aa  217  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3149  hypothetical protein  34.03 
 
 		 723 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3547  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  36.32 
 
 		 456 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0810507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4606  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.44 
 
 		 451 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0726  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  32.2 
 
 		 470 aa  202  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.999189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3678  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  35.71 
 
 		 464 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1105  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.23 
 
 		 459 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4077  putative TRAP transporter solute receptor, TAXI family  30.21 
 
 		 447 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0347504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1371  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  31.74 
 
 		 433 aa  192  9e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5501  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.07 
 
 		 446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2712  putative TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic ligand binding protein  30.29 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.784472  normal  0.536784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0746  TRAP-T family transporter periplasmic substrate binding subunit  27.6 
 
 		 344 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.842378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0741  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1413  TRAP-T family transporter periplasmic binding component  25.96 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3483  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.96 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0239  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.62 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2159  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.11 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.239874  normal  0.13141 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0797  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.26 
 
 		 318 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000423237  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3688  hypothetical protein  25.26 
 
 		 324 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.269569 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4573  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  22.91 
 
 		 446 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4986  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.39 
 
 		 512 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.354924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0184  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.24 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.864216  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1252  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.78 
 
 		 323 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003379  immunogenic protein  28.48 
 
 		 323 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02419  hypothetical protein  28.83 
 
 		 323 aa  50.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2848  immunogenic protein  23.05 
 
 		 328 aa  50.1  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0725  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.62 
 
 		 322 aa  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00793  hypothetical protein  22.89 
 
 		 322 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1890  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25 
 
 		 333 aa  47.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.966009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.72 
 
 		 317 aa  47.4  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.745912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.53 
 
 		 327 aa  47.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.800081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0846  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.46 
 
 		 306 aa  46.6  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.391191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1175  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.86 
 
 		 330 aa  46.6  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155667  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2671  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.3 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2004  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.41 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0468  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.35 
 
 		 316 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1764  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.71 
 
 		 323 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2942  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.81 
 
 		 345 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6904  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.57 
 
 		 329 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001678  TRAP transporter solute receptor TAXI family precursor  26.8 
 
 		 322 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.150837  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2964  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  27.96 
 
 		 340 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0064  hypothetical protein  28.57 
 
 		 363 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.257348 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4887  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  31.47 
 
 		 358 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0373897  normal  0.393187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4237  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  30.33 
 
 		 293 aa  43.5  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0357468  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6347  hypothetical protein  25.45 
 
 		 319 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1781  hypothetical protein  30.77 
 
 		 357 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.568147  unclonable  0.000000000964145 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1346  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.36 
 
 		 316 aa  43.1  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.331988  hitchhiker  0.00000684502 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1472  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.74 
 
 		 651 aa  43.1  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>