91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1803 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2606  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  75.96 
 
 		 445 aa  647    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.909099  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1803  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  100 
 
 		 459 aa  902    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1202  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  75.96 
 
 		 445 aa  645    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1250  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  65.01 
 
 		 445 aa  580  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.05664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3507  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  63.64 
 
 		 456 aa  556  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3678  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  58.72 
 
 		 464 aa  461  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2215  hypothetical protein  53.42 
 
 		 459 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221067  normal  0.771798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2950  hypothetical protein  53.27 
 
 		 445 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0549  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  39.73 
 
 		 441 aa  322  6e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.973361 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2784  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  35.68 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2176  putative TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component protein  36.99 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0717  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  38.08 
 
 		 490 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482708  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0734  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  38.22 
 
 		 496 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146583 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0810  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  37.39 
 
 		 480 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0355  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  37.98 
 
 		 520 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541877  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2081  putative TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component protein  37.12 
 
 		 450 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309573  normal  0.855747 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3930  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  37.09 
 
 		 480 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282648  normal  0.013766 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0838  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  37.39 
 
 		 480 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2546  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  38.02 
 
 		 475 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.644539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3881  hypothetical protein  35.62 
 
 		 494 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0798  hypothetical protein  34.68 
 
 		 497 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.375789 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4606  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  33.33 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3187  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  35.97 
 
 		 499 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3203  hypothetical protein  35.97 
 
 		 499 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2718  hypothetical protein  35.97 
 
 		 479 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.929618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2030  hypothetical protein  35.97 
 
 		 479 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.350637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1892  hypothetical protein  36.2 
 
 		 505 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0884  hypothetical protein  36.2 
 
 		 505 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2417  hypothetical protein  34.73 
 
 		 508 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11470  hypothetical protein  36.03 
 
 		 445 aa  234  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0935266  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3149  hypothetical protein  35.41 
 
 		 723 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4077  putative TRAP transporter solute receptor, TAXI family  31.26 
 
 		 447 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0347504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1255  hypothetical protein  34.08 
 
 		 446 aa  233  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1509  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  32.16 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3645  putative TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component protein  35.01 
 
 		 451 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.746605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2064  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  36.14 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14230  hypothetical protein  31.98 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1263  hypothetical protein  31.74 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236927  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2712  putative TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic ligand binding protein  32.18 
 
 		 460 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.784472  normal  0.536784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5501  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  32.4 
 
 		 446 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1418  hypothetical protein  34.49 
 
 		 444 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3547  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  33.26 
 
 		 456 aa  213  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0810507 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0726  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30 
 
 		 470 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.999189  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1371  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  30.12 
 
 		 433 aa  207  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1105  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.9 
 
 		 459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0797  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.11 
 
 		 318 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000423237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4573  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  22.69 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1697  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.71 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.607751  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1695  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.89 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4597  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.244351  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1194  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.02 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1556  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.6 
 
 		 328 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1156  31 kDa immunogenic protein  25.68 
 
 		 316 aa  55.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2004  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.31 
 
 		 338 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5695  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.25 
 
 		 308 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3723  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.15 
 
 		 316 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2429  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.55 
 
 		 329 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25673  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1890  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.77 
 
 		 333 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.966009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1145  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  23.79 
 
 		 396 aa  51.6  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.97631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1935  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.1 
 
 		 339 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.49167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3793  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  31.65 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.848653  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4419  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25 
 
 		 332 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0725  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  22.05 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1175  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.02 
 
 		 330 aa  49.3  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155667  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0100  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.16 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1445  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.07 
 
 		 307 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2671  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  20.92 
 
 		 325 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1252  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.68 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2283  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.31 
 
 		 320 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.14 
 
 		 317 aa  47.4  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.745912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0137  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.42 
 
 		 350 aa  47.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1472  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  21.6 
 
 		 651 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2331  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.43 
 
 		 322 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2036  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  28.47 
 
 		 463 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6904  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.22 
 
 		 329 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3213  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.15 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0289  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  22.37 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3362  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  32.86 
 
 		 332 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0884862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1764  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.62 
 
 		 323 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1040  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.48 
 
 		 324 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0177  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.17 
 
 		 326 aa  44.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1537  hypothetical protein  23.98 
 
 		 318 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391308  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3839  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.08 
 
 		 327 aa  43.9  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0135422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0817  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23 
 
 		 318 aa  43.9  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000102609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6537  hypothetical protein  30.57 
 
 		 467 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.866176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001678  TRAP transporter solute receptor TAXI family precursor  24.49 
 
 		 322 aa  43.9  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.150837  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1413  TRAP-T family transporter periplasmic binding component  29.82 
 
 		 324 aa  43.9  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3483  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.82 
 
 		 324 aa  43.9  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4512  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.63 
 
 		 299 aa  43.5  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02419  hypothetical protein  25.53 
 
 		 323 aa  43.5  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4887  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.73 
 
 		 358 aa  43.1  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0373897  normal  0.393187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>