124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4077 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4606  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  75.84 
 
 		 451 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2712  putative TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic ligand binding protein  72.17 
 
 		 460 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.784472  normal  0.536784 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4077  putative TRAP transporter solute receptor, TAXI family  100 
 
 		 447 aa  909    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0347504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5501  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  71.07 
 
 		 446 aa  626  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0549  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  40.62 
 
 		 441 aa  318  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.973361 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2784  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  37.16 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2215  hypothetical protein  33.25 
 
 		 459 aa  257  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221067  normal  0.771798 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1250  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  33.66 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.05664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2950  hypothetical protein  34.15 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3881  hypothetical protein  35.34 
 
 		 494 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0798  hypothetical protein  35.34 
 
 		 497 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.375789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3930  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  35.48 
 
 		 480 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282648  normal  0.013766 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1803  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.55 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0717  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  35.71 
 
 		 490 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482708  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0734  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  35.71 
 
 		 496 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0355  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  35.48 
 
 		 520 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0838  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  35.48 
 
 		 480 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0810  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  35.48 
 
 		 480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2546  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  34.83 
 
 		 475 aa  240  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.644539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1202  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.55 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2606  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.55 
 
 		 445 aa  237  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.909099  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2417  hypothetical protein  34.47 
 
 		 508 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3507  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.98 
 
 		 456 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2176  putative TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component protein  33.57 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3645  putative TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component protein  34.26 
 
 		 451 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.746605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3203  hypothetical protein  31.98 
 
 		 499 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2030  hypothetical protein  31.98 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.350637  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0884  hypothetical protein  31.98 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2718  hypothetical protein  31.98 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.929618  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3187  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  31.98 
 
 		 499 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1892  hypothetical protein  31.98 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3149  hypothetical protein  31.98 
 
 		 723 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0726  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.84 
 
 		 470 aa  217  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.999189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3678  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  34.1 
 
 		 464 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11470  hypothetical protein  30.22 
 
 		 445 aa  209  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0935266  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2081  putative TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component protein  33 
 
 		 450 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309573  normal  0.855747 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1509  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.41 
 
 		 433 aa  206  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1105  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.5 
 
 		 459 aa  203  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1371  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  32.92 
 
 		 433 aa  203  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1418  hypothetical protein  30.42 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1263  hypothetical protein  30.05 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14230  hypothetical protein  29.33 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2064  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.61 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3547  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  28.26 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0810507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4573  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.76 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1194  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.57 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3213  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.81 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1764  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.09 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4597  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  22.57 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.244351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2004  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.08 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1156  31 kDa immunogenic protein  28.23 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0797  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.62 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000423237  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0725  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.68 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1697  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  32.56 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.607751  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1252  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.37 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3688  hypothetical protein  25.29 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.269569 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2429  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.06 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25673  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0177  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.55 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.18 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.800081  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2671  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.05 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3839  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.34 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0135422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1413  TRAP-T family transporter periplasmic binding component  26.76 
 
 		 324 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3483  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.76 
 
 		 324 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4446  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.82 
 
 		 323 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2159  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.59 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.239874  normal  0.13141 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1890  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.34 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.966009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0645  immunogenic protein  25 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.208055  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1695  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.04 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0314  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.53 
 
 		 317 aa  63.2  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.889469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4986  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.54 
 
 		 512 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.354924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0817  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.2 
 
 		 318 aa  62.8  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000102609  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2331  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.2 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001678  TRAP transporter solute receptor TAXI family precursor  24.24 
 
 		 322 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.150837  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2848  immunogenic protein  22.81 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0289  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.5 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00793  hypothetical protein  23.91 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1556  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0356  hypothetical protein  23.36 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.097907  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0394  putative immunogenic protein  22.34 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0147572  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003379  immunogenic protein  23.94 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1040  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.14 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1443  TRAP transporter solute receptor  27.27 
 
 		 322 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.552427 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3723  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.2 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0082  immunogenic protein  23.21 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0148349  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02419  hypothetical protein  23.83 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1472  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.61 
 
 		 651 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0608  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.83 
 
 		 326 aa  57  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.516133  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0649  DNA primase  27.82 
 
 		 313 aa  57  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0664  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.85 
 
 		 333 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0371  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.32 
 
 		 329 aa  55.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.671044  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0114  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.55 
 
 		 332 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.98 
 
 		 317 aa  54.7  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.745912 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1635  TAXI family TRAP transporter solute receptor  24.91 
 
 		 315 aa  53.5  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0832335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1935  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.41 
 
 		 339 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.49167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0846  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.14 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.391191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1445  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.33 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4419  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.19 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0539  immunogenic protein  24.09 
 
 		 313 aa  52.4  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1229  putative immunogenic protein precursor  24.31 
 
 		 310 aa  52.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>