184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3149 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2030  hypothetical protein  99.11 
 
 
479 aa  859    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.350637  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0810  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  79.29 
 
 
480 aa  686    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347911  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3203  hypothetical protein  99.11 
 
 
499 aa  859    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3930  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  79.05 
 
 
480 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282648  normal  0.013766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1418  hypothetical protein  85.41 
 
 
444 aa  756    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0734  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  79.41 
 
 
496 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0355  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  79.29 
 
 
520 aa  684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0717  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  75.21 
 
 
490 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482708  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0838  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  79.29 
 
 
480 aa  684    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0884  hypothetical protein  99.11 
 
 
505 aa  860    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2718  hypothetical protein  99.11 
 
 
479 aa  859    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.929618  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3149  hypothetical protein  100 
 
 
723 aa  1456    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3187  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  99.11 
 
 
499 aa  862    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1892  hypothetical protein  99.11 
 
 
505 aa  860    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2546  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  79.73 
 
 
475 aa  657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.644539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0798  hypothetical protein  67.11 
 
 
497 aa  598  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.375789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3881  hypothetical protein  68.17 
 
 
494 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2417  hypothetical protein  65.69 
 
 
508 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2784  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  55.79 
 
 
446 aa  463  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2176  putative TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component protein  53.19 
 
 
450 aa  452  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2031  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  99.53 
 
 
212 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3204  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  99.53 
 
 
212 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2081  putative TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component protein  51.9 
 
 
450 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309573  normal  0.855747 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0883  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  99.53 
 
 
212 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2717  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  99.53 
 
 
212 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3188  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  99.53 
 
 
212 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1893  thioredoxin domain-containing protein  99.53 
 
 
212 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389151  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3645  putative TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component protein  54.98 
 
 
451 aa  435  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.746605  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  97.17 
 
 
212 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1255  hypothetical protein  45.11 
 
 
446 aa  354  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0797  DSBA oxidoreductase  73.58 
 
 
216 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3882  putative isomerase  73.93 
 
 
216 aa  332  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2418  DSBA oxidoreductase  71.56 
 
 
214 aa  331  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485422  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0716  DSBA oxidoreductase  71.9 
 
 
212 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.759492  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2547  DSBA oxidoreductase  71.23 
 
 
212 aa  325  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.435599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0733  DSBA oxidoreductase  71.9 
 
 
212 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3929  DSBA oxidoreductase  71.43 
 
 
212 aa  324  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0559828  normal  0.0117415 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0549  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  42.11 
 
 
441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.973361 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0809  DSBA oxidoreductase  72.17 
 
 
212 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0353  DSBA oxidoreductase  72.17 
 
 
212 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.824557  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0837  DSBA oxidoreductase  72.17 
 
 
212 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2215  hypothetical protein  38.7 
 
 
459 aa  279  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221067  normal  0.771798 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1250  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  37.19 
 
 
445 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.05664  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2950  hypothetical protein  37.61 
 
 
445 aa  256  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2606  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  37.27 
 
 
445 aa  251  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.909099  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1202  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  37.05 
 
 
445 aa  250  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1509  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  35.73 
 
 
433 aa  247  6e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3507  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  35.6 
 
 
456 aa  247  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4606  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  34.16 
 
 
451 aa  246  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1803  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  35.97 
 
 
459 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14230  hypothetical protein  34.49 
 
 
451 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2712  putative TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic ligand binding protein  32.94 
 
 
460 aa  230  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.784472  normal  0.536784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1263  hypothetical protein  34.72 
 
 
451 aa  230  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236927  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1105  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.66 
 
 
459 aa  228  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5501  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  34.8 
 
 
446 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321454  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1371  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  34.15 
 
 
433 aa  225  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4077  putative TRAP transporter solute receptor, TAXI family  32.36 
 
 
447 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0347504  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11470  hypothetical protein  33.73 
 
 
445 aa  218  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0935266  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2064  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  33.72 
 
 
457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.174076 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0726  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.36 
 
 
470 aa  215  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.999189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3547  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  34.57 
 
 
456 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0810507 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5350  DSBA oxidoreductase  53.23 
 
 
212 aa  214  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527741  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4809  DSBA oxidoreductase  53.23 
 
 
212 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287692  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0187  DSBA oxidoreductase  53.23 
 
 
212 aa  211  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5394  DSBA oxidoreductase  53.23 
 
 
212 aa  210  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458374  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5467  DSBA oxidoreductase  53.23 
 
 
212 aa  210  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0340236  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3319  DSBA oxidoreductase  52.24 
 
 
212 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4802  DSBA oxidoreductase  51.94 
 
 
212 aa  208  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3678  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  35.28 
 
 
464 aa  200  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4027  DSBA oxidoreductase  49.75 
 
 
211 aa  198  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4139  DSBA oxidoreductase  49.75 
 
 
211 aa  198  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3375  DSBA oxidoreductase  38.38 
 
 
210 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0747  DSBA oxidoreductase  35.78 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.340191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4153  DSBA oxidoreductase  35.55 
 
 
217 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0479  DSBA oxidoreductase  34.87 
 
 
229 aa  108  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4707  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
214 aa  101  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3816  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 
210 aa  100  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4346  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 
216 aa  98.6  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3753  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 
217 aa  92.8  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.819118  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3351  putative isomerase  34.18 
 
 
218 aa  92.8  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3034  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 
217 aa  92.4  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0517  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 
218 aa  89.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270778  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2347  DSBA oxidoreductase  32.98 
 
 
205 aa  86.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000115912  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5961  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
211 aa  79  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01440  hypothetical protein  27.66 
 
 
195 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5282  DSBA oxidoreductase  32.02 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  27.27 
 
 
195 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  26.6 
 
 
197 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.730832 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  29.56 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  25.93 
 
 
197 aa  67.4  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5264  hypothetical protein  29.84 
 
 
200 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193912  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0342  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.86 
 
 
423 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450847  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3908  DSBA oxidoreductase  27.37 
 
 
196 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4573  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.37 
 
 
446 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2187  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 
201 aa  62  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2652  DSBA oxidoreductase  30.83 
 
 
218 aa  62  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.34917  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3151  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 
206 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1459  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 
218 aa  60.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2763  DSBA oxidoreductase  36.04 
 
 
204 aa  60.1  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  25.14 
 
 
195 aa  58.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0949861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>