155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4986 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4986  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  100 
 
 
512 aa  1056    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.354924  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4573  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.34 
 
 
446 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2671  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.79 
 
 
325 aa  95.1  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4597  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.78 
 
 
454 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.244351  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0314  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.08 
 
 
317 aa  93.2  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.889469  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1695  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.24 
 
 
315 aa  91.3  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1764  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.25 
 
 
323 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513988  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4417  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.1 
 
 
348 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0674202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1697  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.6 
 
 
330 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.607751  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3839  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.16 
 
 
327 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0135422  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3440  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.33 
 
 
342 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.93321  normal  0.103466 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00793  hypothetical protein  29.24 
 
 
322 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1252  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.64 
 
 
323 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1537  hypothetical protein  26.21 
 
 
318 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391308  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2848  immunogenic protein  27.19 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4512  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.83 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0468  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.29 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3688  hypothetical protein  26.54 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.269569 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1346  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.64 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.331988  hitchhiker  0.00000684502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1556  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.34 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0881  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.67 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.000456072  normal  0.0650778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6904  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.28 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1040  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.05 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0664  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.95 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2331  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.85 
 
 
322 aa  76.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699297  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001678  TRAP transporter solute receptor TAXI family precursor  28.46 
 
 
322 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.150837  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0177  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.25 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.35 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.800081  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0356  hypothetical protein  28.74 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.097907  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.09 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.745912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3723  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.08 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1890  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.966009  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0725  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.63 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5695  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.18 
 
 
308 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0137  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.21 
 
 
350 aa  72.8  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1413  TRAP-T family transporter periplasmic binding component  26.15 
 
 
324 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2004  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.93 
 
 
338 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373091  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3483  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.15 
 
 
324 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0082  immunogenic protein  23.15 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0148349  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1194  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.32 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1935  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.37 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.49167  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0817  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.08 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000102609  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0645  immunogenic protein  26.42 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.208055  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003379  immunogenic protein  26.33 
 
 
323 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0431  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.38 
 
 
316 aa  69.3  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4446  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.32 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0746  TRAP-T family transporter periplasmic substrate binding subunit  23.7 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.842378  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2159  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.05 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.239874  normal  0.13141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4560  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.59 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1613  TRAP dicarboxylate family transporter DctP subunit  24.51 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0267  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.51 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418804  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0797  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  30.37 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000423237  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0549  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.09 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.973361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2149  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.94 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0737588  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3381  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.44 
 
 
318 aa  66.6  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2329  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.41 
 
 
349 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.809783 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0608  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.64 
 
 
326 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.516133  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0224  hypothetical protein  25.48 
 
 
367 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2429  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.9 
 
 
329 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25673  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0539  immunogenic protein  22.01 
 
 
313 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02419  hypothetical protein  24.92 
 
 
323 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3808  hypothetical protein  25.48 
 
 
367 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.312034  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4419  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.45 
 
 
332 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0640  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.63 
 
 
356 aa  65.1  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0289  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.85 
 
 
337 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1781  hypothetical protein  25.97 
 
 
357 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.568147  unclonable  0.000000000964145 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0290  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.32 
 
 
317 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0541635  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1156  31 kDa immunogenic protein  25.99 
 
 
316 aa  63.9  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1472  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.83 
 
 
651 aa  63.5  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0064  hypothetical protein  26.25 
 
 
363 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.257348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0114  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.15 
 
 
332 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1635  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.38 
 
 
319 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2520  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.85 
 
 
335 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11470  hypothetical protein  25.61 
 
 
445 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0935266  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1443  TRAP transporter solute receptor  24.22 
 
 
322 aa  62.4  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.552427 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0741  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.47 
 
 
348 aa  62  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4077  putative TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.28 
 
 
447 aa  62  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0347504  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4067  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.32 
 
 
318 aa  61.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.548232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73120  hypothetical protein  26.89 
 
 
319 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2942  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25 
 
 
345 aa  60.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3295  KDPG and KHG aldolase  27.69 
 
 
349 aa  60.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.808807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3954  periplasmic binding protein, putative  24.75 
 
 
316 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.391333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6347  hypothetical protein  26.2 
 
 
319 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4887  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.71 
 
 
358 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0373897  normal  0.393187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2712  putative TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic ligand binding protein  25.32 
 
 
460 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.784472  normal  0.536784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2072  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  21.24 
 
 
317 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169091 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4032  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.74 
 
 
348 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0151449  normal  0.772934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1255  hypothetical protein  25.26 
 
 
446 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4606  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25 
 
 
451 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3299  TRAP-T family transporter periplasmic binding component  28.74 
 
 
348 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.783922  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0394  putative immunogenic protein  21.93 
 
 
326 aa  58.2  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0147572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0456  immunogenic-related protein  27.24 
 
 
318 aa  58.2  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1445  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.7 
 
 
307 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0033  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  22.64 
 
 
319 aa  58.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4331  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.22 
 
 
453 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.794472  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0461  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.64 
 
 
318 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3568  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.64 
 
 
318 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0457  response regulator receiver protein  27.64 
 
 
318 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0713  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  31.11 
 
 
342 aa  57.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2594  TRAP transporter solute receptor, TAXI family protein  30.65 
 
 
310 aa  57.4  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.323017 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>