85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2176 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2081  putative TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component protein  91.98 
 
 		 450 aa  794    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309573  normal  0.855747 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2176  putative TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component protein  100 
 
 		 450 aa  901    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3645  putative TRAP-type uncharacterized transport system, periplasmic component protein  72.22 
 
 		 451 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.746605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3881  hypothetical protein  57.11 
 
 		 494 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0798  hypothetical protein  56.49 
 
 		 497 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.375789 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2417  hypothetical protein  55.94 
 
 		 508 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3930  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  54.95 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282648  normal  0.013766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0717  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  53.81 
 
 		 490 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2546  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  55.08 
 
 		 475 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.644539 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0810  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  54.8 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0734  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  54.93 
 
 		 496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0355  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  54.57 
 
 		 520 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0838  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  54.57 
 
 		 480 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2784  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  54.91 
 
 		 446 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3203  hypothetical protein  52.28 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2030  hypothetical protein  52.28 
 
 		 479 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.350637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1892  hypothetical protein  52.28 
 
 		 505 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3187  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase  52.28 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2718  hypothetical protein  52.28 
 
 		 479 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.929618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0884  hypothetical protein  52.28 
 
 		 505 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3149  hypothetical protein  52.17 
 
 		 723 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1418  hypothetical protein  49.76 
 
 		 444 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1255  hypothetical protein  48.23 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0549  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  41.53 
 
 		 441 aa  319  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.973361 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1202  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  39.86 
 
 		 445 aa  276  6e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2606  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  39.86 
 
 		 445 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.909099  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2215  hypothetical protein  38.33 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221067  normal  0.771798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2950  hypothetical protein  38.8 
 
 		 445 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1250  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  38 
 
 		 445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.05664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3507  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  37.56 
 
 		 456 aa  264  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14230  hypothetical protein  36.56 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1263  hypothetical protein  36.79 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236927  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1803  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  36.99 
 
 		 459 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1509  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  33.89 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4606  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  34.89 
 
 		 451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1371  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  33.82 
 
 		 433 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2712  putative TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic ligand binding protein  34.12 
 
 		 460 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.784472  normal  0.536784 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1105  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  32.77 
 
 		 459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0726  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.63 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.999189  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2064  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  35.71 
 
 		 457 aa  221  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11470  hypothetical protein  34.52 
 
 		 445 aa  219  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0935266  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4077  putative TRAP transporter solute receptor, TAXI family  33.5 
 
 		 447 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0347504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3547  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  32.95 
 
 		 456 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0810507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3678  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  34.11 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5501  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  32.87 
 
 		 446 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4573  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.36 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0713  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  33.71 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0881  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  30.91 
 
 		 346 aa  53.1  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.000456072  normal  0.0650778 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1229  putative immunogenic protein precursor  28.45 
 
 		 310 aa  53.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144519  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0394  putative immunogenic protein  22.22 
 
 		 326 aa  52.8  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0147572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6904  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.27 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4597  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.47 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.244351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.01 
 
 		 327 aa  50.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.800081  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2036  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  24.54 
 
 		 463 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0585  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.28 
 
 		 341 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1537  hypothetical protein  30.29 
 
 		 318 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391308  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1175  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.5 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155667  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1853  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  32.59 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.45766 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0797  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.56 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000423237  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3793  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.47 
 
 		 333 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.848653  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4419  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.39 
 
 		 332 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0640  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.24 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2004  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  22.6 
 
 		 338 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4446  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.92 
 
 		 323 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1253  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.73 
 
 		 323 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1935  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.86 
 
 		 339 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.49167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0746  TRAP-T family transporter periplasmic substrate binding subunit  25.42 
 
 		 344 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.842378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1472  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  29.17 
 
 		 651 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0846  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.19 
 
 		 306 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.391191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2329  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.65 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.809783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5695  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.54 
 
 		 308 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.99 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.745912 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0741  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.61 
 
 		 348 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0207  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.73 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.979925 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0114  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.06 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3299  TRAP-T family transporter periplasmic binding component  26.11 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.783922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2283  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.78 
 
 		 320 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4032  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.11 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0151449  normal  0.772934 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1346  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.84 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.331988  hitchhiker  0.00000684502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2365  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.78 
 
 		 328 aa  44.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0289  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.62 
 
 		 337 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0608  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.62 
 
 		 326 aa  43.9  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.516133  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3295  KDPG and KHG aldolase  27.47 
 
 		 349 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.808807 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0380  periplasmic-binding protein  26.09 
 
 		 342 aa  43.1  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000526249  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0239  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.27 
 
 		 453 aa  43.1  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264256  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>