49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4237 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4237  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 293 aa  590  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0357468  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1548  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  31.88 
 
 		 296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1263  hypothetical protein  30.42 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14230  hypothetical protein  29.9 
 
 		 451 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4573  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.57 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2429  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.3 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25673  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1156  31 kDa immunogenic protein  29.79 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1194  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.88 
 
 		 329 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0468  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.23 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0817  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.14 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000102609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1697  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.56 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.607751  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0746  TRAP-T family transporter periplasmic substrate binding subunit  25.86 
 
 		 344 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.842378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11470  hypothetical protein  27.86 
 
 		 445 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0935266  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1635  TAXI family TRAP transporter solute receptor  27.68 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0832335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.745912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4986  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.81 
 
 		 512 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.354924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0741  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.23 
 
 		 348 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6904  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.53 
 
 		 329 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2159  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26.79 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.239874  normal  0.13141 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0797  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.06 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000423237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1537  hypothetical protein  27.35 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391308  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0549  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.92 
 
 		 441 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.973361 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2942  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.67 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2072  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.15 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1255  hypothetical protein  27.16 
 
 		 446 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3359  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.76 
 
 		 366 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  hitchhiker  0.000000000800909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.92 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.800081  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3547  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  31.97 
 
 		 456 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0810507 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2064  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.77 
 
 		 457 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174076 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001678  TRAP transporter solute receptor TAXI family precursor  26.29 
 
 		 322 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.150837  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0380  periplasmic-binding protein  25.27 
 
 		 342 aa  45.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000526249  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4887  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.68 
 
 		 358 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0373897  normal  0.393187 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0314  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  29.23 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.889469  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0356  hypothetical protein  25.1 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.097907  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2784  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  26 
 
 		 446 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1695  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.93 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00793  hypothetical protein  24.57 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4101  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.36 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32075  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4226  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.1 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0963703  normal  0.823727 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3299  TRAP-T family transporter periplasmic binding component  25.1 
 
 		 348 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.783922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0461  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.1 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0289  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  25.93 
 
 		 337 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1781  hypothetical protein  28.68 
 
 		 357 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.568147  unclonable  0.000000000964145 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3568  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.1 
 
 		 318 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0457  response regulator receiver protein  24.1 
 
 		 318 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4032  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.59 
 
 		 348 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0151449  normal  0.772934 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0137  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.6 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0664  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.83 
 
 		 333 aa  42.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2848  immunogenic protein  24.21 
 
 		 328 aa  42.4  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>