203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4421 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4421  DNA primase, small subunit  100 
 
 		 326 aa  635    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.569528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1933  hypothetical protein  87.99 
 
 		 318 aa  501  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5608  DNA primase, small subunit  78.73 
 
 		 319 aa  474  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.613871  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5228  hypothetical protein  79.93 
 
 		 310 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5316  hypothetical protein  79.93 
 
 		 310 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0553  DNA primase small subunit  67.87 
 
 		 335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3663  DNA primase, small subunit  64.26 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.735103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2717  DNA primase small subunit  67.09 
 
 		 326 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00546192  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4039  DNA polymerase LigD polymerase subunit  66.89 
 
 		 319 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437287  normal  0.0570226 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4169  DNA primase small subunit  60.8 
 
 		 332 aa  354  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1360  DNA primase small subunit  59.74 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0598  hypothetical protein  39.58 
 
 		 314 aa  170  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.479165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2067  hypothetical protein  39.3 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0552463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1124  hypothetical protein  35.27 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2082  hypothetical protein  37.79 
 
 		 306 aa  165  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2863  DNA primase-like  35.63 
 
 		 352 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  32.27 
 
 		 896 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  29.78 
 
 		 855 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1986  DNA primase, small subunit  33.21 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328453  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  32.75 
 
 		 815 aa  146  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  33.11 
 
 		 861 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7781  putative DNA ligase-like protein  35.4 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0711104  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  31.3 
 
 		 902 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15620  DNA polymerase LigD, polymerase domain  38.83 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  37.55 
 
 		 896 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3248  DNA polymerase LigD polymerase subunit  34.62 
 
 		 328 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  34.85 
 
 		 815 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2031  hypothetical protein  36.76 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232126  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  29.26 
 
 		 646 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  38.65 
 
 		 656 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  35 
 
 		 847 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1787  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.14 
 
 		 340 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1571  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  38.46 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3085  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  30.43 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2802  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  34.71 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0962  hypothetical protein  39.43 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.612546  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0139  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.11 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1945  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.93 
 
 		 355 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000971032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4154  DNA primase small subunit  36.07 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1670  DNA primase-like  35.82 
 
 		 527 aa  136  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447053  hitchhiker  0.00316977 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1020  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  38.31 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00719502  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  33.45 
 
 		 865 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  38.85 
 
 		 658 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1023  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  39.02 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  35.79 
 
 		 822 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3426  hypothetical protein  37.5 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5249  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.94 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  30.94 
 
 		 877 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  30.93 
 
 		 813 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2815  DNA polymerase LigD, polymerase domain-containing protein  34.13 
 
 		 305 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4351  DNA polymerase LigD polymerase subunit  36.76 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2239  DNA ligase D  36.3 
 
 		 856 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.839838 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1207  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  37.31 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.560779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  32.05 
 
 		 871 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3967  DNA primase, small subunit  35.86 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.641256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  37.05 
 
 		 684 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0836  DNA ligase D  37.41 
 
 		 683 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03410  DNA polymerase LigD polymerase domain protein  26.71 
 
 		 313 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  31.91 
 
 		 872 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  36.23 
 
 		 354 aa  129  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0275907  hitchhiker  0.000216971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1378  hypothetical protein  37.6 
 
 		 339 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200655  normal  0.549475 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  33.9 
 
 		 825 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1237  ATP dependent DNA ligase  33.73 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2856  DNA primase-like  33.45 
 
 		 455 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101034  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.62 
 
 		 797 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3206  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.98 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1218  ATP dependent DNA ligase  32.97 
 
 		 846 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.257773 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0932  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  38.24 
 
 		 737 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0396  hypothetical protein  36.03 
 
 		 412 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00684947  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2258  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  34.83 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2830  DNA primase small subunit  37.36 
 
 		 427 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  34.98 
 
 		 825 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4308  DNA polymerase LigD polymerase subunit  33.47 
 
 		 306 aa  125  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0935  DNA ligase D, 3'-phosphoesterase domain protein  39.45 
 
 		 789 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0727399  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0584  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  36.48 
 
 		 329 aa  125  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2991  DNA polymerase LigD polymerase domain-containing subunit  38.18 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1007  DNA polymerase LigD polymerase subunit  37.4 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.104732  hitchhiker  0.00609843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6714  DNA primase small subunit  35.23 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0437742  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0342  DNA primase, small subunit  36.3 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.938834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0491  DNA primase small subunit  35.29 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.209898  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34930  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.25 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564701  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  32.72 
 
 		 845 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  32.16 
 
 		 834 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0884  ATP dependent DNA ligase  37.5 
 
 		 726 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.911309  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  33.66 
 
 		 778 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2679  ATP-dependent DNA ligase  32.17 
 
 		 868 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2445  putative DNA ligase (ATP), C-terminal  35.09 
 
 		 326 aa  122  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.858354  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2236  DNA primase small subunit  35.97 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848931  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0360  hypothetical protein  36.36 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4915  hypothetical protein  36.23 
 
 		 347 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0370  hypothetical protein  36.36 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5004  hypothetical protein  36.23 
 
 		 347 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.761919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  32.73 
 
 		 651 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  31.41 
 
 		 864 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0349  DNA primase, small subunit  36.36 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5283  DNA primase, small subunit  36.23 
 
 		 347 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1543  DNA primase, small subunit  37.27 
 
 		 341 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2095  DNA primase, small subunit  36.07 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59622  normal  0.161983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0382  DNA ligase D  35.23 
 
 		 644 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3272  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35.34 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>