146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1707 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1707  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  46.93 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  42.13 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  37.36 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  40.68 
 
 		 181 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  41.9 
 
 		 177 aa  120  8e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  38.46 
 
 		 183 aa  115  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  35.06 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 181 aa  97.8  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  32.79 
 
 		 180 aa  88.2  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  32.09 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  31.43 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  32.02 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  31.84 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  30.9 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  29.84 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  31.32 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  34.57 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  30.73 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  30.39 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  29.12 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  32.02 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  30.39 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  29.26 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  29.12 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  27.84 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  27.68 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  29.95 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  30.94 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  28.42 
 
 		 194 aa  72  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  30.39 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  30.86 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  28.95 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  29.44 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  31.47 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  29.61 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  26.4 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  31.95 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  31.52 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  34.07 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  28.88 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  30.29 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  30.32 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  26.55 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  27.6 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  28.26 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  27.93 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  28.49 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  25.27 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  24.86 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  31.37 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  28.49 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  27.78 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  30.61 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  27.21 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  30.61 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25.14 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  30.69 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  27.34 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  30.61 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  26.87 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  31.97 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.12 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  25.57 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  26.87 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  29.79 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  25.57 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  25.57 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  25.57 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25.57 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  25.14 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  25.57 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  26.23 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  24.58 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  27.27 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  22.56 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  34.09 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  23.26 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  26.14 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  26.97 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  26.72 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 298 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  23.46 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  27.07 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  26.87 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  27.07 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  29.73 
 
 		 194 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  22.95 
 
 		 202 aa  51.2  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  26.55 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>