More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1331 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1331  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  100 
 
 
441 aa  855    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.446263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2122  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  57.76 
 
 
439 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.580751  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2569  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  58.52 
 
 
447 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.175958  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3674  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  54.69 
 
 
443 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1482  TRAP dicarboxylate transporter  51.44 
 
 
450 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.17779  normal  0.355588 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3499  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  52.2 
 
 
439 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160253  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0282  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  51.14 
 
 
440 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7096  TRAP dicarboxylate family transporter DctM subunit  43.65 
 
 
439 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0936946  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3915  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  42.89 
 
 
433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3580  TRAP dicarboxylate transporter DctM subunit  43.59 
 
 
436 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.263303  normal  0.28531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1986  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  43.91 
 
 
435 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95556  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3026  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  44.98 
 
 
439 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.109071 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3129  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  51.23 
 
 
501 aa  339  5e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.717892  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2491  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  46.73 
 
 
439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1963  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  39.72 
 
 
429 aa  332  7.000000000000001e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.351105  normal  0.0549575 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2259  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  39.03 
 
 
429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.105706  normal  0.0552322 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0663  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  48.77 
 
 
533 aa  327  3e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00984856  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1706  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  43.19 
 
 
436 aa  317  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0711  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  40.64 
 
 
428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3088  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  42.25 
 
 
442 aa  310  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0878364  hitchhiker  0.00879182 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0646  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  43.05 
 
 
434 aa  309  8e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.492149  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1338  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  42.82 
 
 
437 aa  308  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.896332  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2214  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  43.09 
 
 
439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0578484  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0329  TRAP dicarboxylate transporter-DctM subunit  39.12 
 
 
437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000362936  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0305  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  40.38 
 
 
428 aa  300  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.805991  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0514  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  40.23 
 
 
434 aa  299  7e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3770  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  38.75 
 
 
437 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3170  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  41.24 
 
 
442 aa  296  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0742622  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2001  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  40.18 
 
 
433 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.122119  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0334  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  41.16 
 
 
434 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0049  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.33 
 
 
591 aa  282  8.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1305  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  40.58 
 
 
430 aa  278  9e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3791  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  39.63 
 
 
593 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0543845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0636  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  39.28 
 
 
433 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2185  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.53 
 
 
436 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0611  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  34.05 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680985  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4621  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.6 
 
 
433 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.22928  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3539  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.67 
 
 
436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248522  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2057  hypothetical protein  34.13 
 
 
421 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.567806  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3222  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  35.33 
 
 
466 aa  237  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00234978  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5034  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.81 
 
 
429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3519  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  35.42 
 
 
481 aa  236  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2458  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.77 
 
 
432 aa  226  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1735  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.78 
 
 
428 aa  216  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.242246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1469  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.23 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.915516  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0634  TRAP dicarboxylate family transporter DctM subunit  35.51 
 
 
435 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2661  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.02 
 
 
462 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2287  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.05 
 
 
435 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52701  normal  0.181446 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2567  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  35.39 
 
 
427 aa  207  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1779  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  32.04 
 
 
436 aa  204  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.702911  normal  0.013315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1607  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.49 
 
 
433 aa  203  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0872  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  35.02 
 
 
438 aa  202  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0564449  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1069  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.57 
 
 
426 aa  202  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000354395  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3001  TRAP transporter - DctM subunit  32.41 
 
 
438 aa  202  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0605  TRAP dicarboxylate transporter  35.39 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3713  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.92 
 
 
436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000455395  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3544  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.34 
 
 
434 aa  199  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.326027  normal  0.804192 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0024  permease (transport protein)  30.83 
 
 
424 aa  195  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1037  TRAP dicarboxylate transporter  31.48 
 
 
434 aa  195  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1574  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.13 
 
 
459 aa  195  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0642  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  32.09 
 
 
434 aa  195  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0477916 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0559  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  30.62 
 
 
446 aa  193  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3266  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.94 
 
 
427 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341254  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3429  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  31.23 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.276391  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0558  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  34.96 
 
 
430 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.325527  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4120  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  31.99 
 
 
440 aa  190  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141301  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3207  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.76 
 
 
427 aa  190  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3673  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  32.63 
 
 
438 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1024  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  32.72 
 
 
433 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0364171  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3096  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  32.26 
 
 
433 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.109822  normal  0.586288 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3451  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  32.26 
 
 
433 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0331504  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0112  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.85 
 
 
430 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0312276  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1822  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.3 
 
 
460 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00945671  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2991  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.13 
 
 
427 aa  187  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0932755  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2037  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  33.76 
 
 
435 aa  187  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.617439  normal  0.388769 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1876  TRAP dicarboxylate transporter subunit DctM  32.14 
 
 
436 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00220831  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0572  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  29.98 
 
 
439 aa  187  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68290  C4-dicarboxylate transporter  35.24 
 
 
427 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3155  TRAP transporter- DctM subunit  36.04 
 
 
429 aa  186  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4930  putative TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component  32.19 
 
 
434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665139  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4508  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  31.28 
 
 
440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1477  TRAP dicarboxylate family transporter DctM subunit  29.33 
 
 
506 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347745  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2262  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.5 
 
 
441 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2115  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  34.02 
 
 
441 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288069  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5908  C4-dicarboxylate transporter  35.48 
 
 
427 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.75076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2787  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.21 
 
 
459 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1091  TRAP dicarboxylate transporter  38.58 
 
 
424 aa  182  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.1392  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1772  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  34.93 
 
 
431 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3676  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.13 
 
 
427 aa  182  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_3757  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  29.88 
 
 
435 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2485  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.77 
 
 
434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0269411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0032  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  29.47 
 
 
440 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0528554  normal 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1375  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.48 
 
 
434 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_2786  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  30.75 
 
 
439 aa  179  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.10169  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0630  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  31.78 
 
 
450 aa  179  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.123328  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_6041  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component (dctM subunit)  33.76 
 
 
441 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.145661  normal 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0859  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  30.24 
 
 
425 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.322805 
 
 
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NC_009439  Pmen_4297  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.81 
 
 
426 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008254  Meso_2937  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  30.88 
 
 
440 aa  177  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.481353  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_3327  TRAP dicarboxylate transporter DctM subunit  33.66 
 
 
430 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.868747  normal  0.343483 
 
 
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