237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0706 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
145 aa  287  3e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0735  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.31 
 
 
145 aa  105  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.29 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.01 
 
 
227 aa  70.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.56 
 
 
598 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37 
 
 
223 aa  60.8  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314635  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3610  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37 
 
 
221 aa  60.5  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302219  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.45 
 
 
216 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1917  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.56 
 
 
227 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
603 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2270  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.56 
 
 
227 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.92 
 
 
225 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2299  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.92 
 
 
225 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3344  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.98 
 
 
332 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1189  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.05 
 
 
223 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.04 
 
 
230 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2273  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.04 
 
 
230 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.96 
 
 
217 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138334 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.96 
 
 
217 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.62 
 
 
229 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265292  hitchhiker  0.00010169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3003  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.37 
 
 
215 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.85 
 
 
216 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2300  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
215 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2613  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.37 
 
 
215 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.73 
 
 
235 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1023  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.85 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0768  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.08 
 
 
234 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.08 
 
 
234 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  28.72 
 
 
214 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.48 
 
 
555 aa  55.1  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.85 
 
 
233 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4594  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28 
 
 
215 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.1 
 
 
253 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.85 
 
 
233 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143236  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.69 
 
 
221 aa  53.9  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.85 
 
 
233 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.48 
 
 
680 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
598 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.04 
 
 
671 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.48 
 
 
655 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2098  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28 
 
 
245 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211471  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.04 
 
 
255 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.73 
 
 
208 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.25 
 
 
455 aa  52  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.46 
 
 
192 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  29.25 
 
 
455 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.04 
 
 
252 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.04 
 
 
252 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.04 
 
 
252 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  29.09 
 
 
453 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.82 
 
 
457 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.09 
 
 
585 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.57 
 
 
607 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  31 
 
 
201 aa  50.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  29.91 
 
 
275 aa  50.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.03 
 
 
220 aa  50.1  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  27.03 
 
 
220 aa  50.1  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.19 
 
 
214 aa  50.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.32 
 
 
199 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.68 
 
 
204 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.17 
 
 
220 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03434  putative Tol protein  30.21 
 
 
454 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  29.35 
 
 
251 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.47 
 
 
235 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.8 
 
 
226 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.21 
 
 
469 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  29.66 
 
 
451 aa  48.9  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.09 
 
 
208 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27 
 
 
224 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
206 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.72 
 
 
250 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.18 
 
 
478 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0549  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.23 
 
 
247 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23318  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28 
 
 
238 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3906  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.12 
 
 
196 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.286845  normal  0.293846 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  26 
 
 
245 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.48 
 
 
233 aa  47.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0517  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.48 
 
 
195 aa  47.8  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.11 
 
 
207 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.44 
 
 
235 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.484595  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.81 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 
339 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.5 
 
 
206 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
206 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  24.78 
 
 
220 aa  46.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2642  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  24.56 
 
 
235 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2455  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  24.56 
 
 
235 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3454  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  24.56 
 
 
235 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3452  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  24.56 
 
 
235 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.35 
 
 
206 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0372  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  24.56 
 
 
235 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.17 
 
 
216 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1231  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  24.56 
 
 
235 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  26 
 
 
225 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.79 
 
 
218 aa  45.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.256552  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.73 
 
 
222 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250468 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  31.52 
 
 
253 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0619  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.23 
 
 
222 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.701482  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  38.33 
 
 
464 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  31.07 
 
 
220 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>