More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2018 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  100 
 
 
275 aa  547  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60 
 
 
277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0347861  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4055  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.2 
 
 
279 aa  297  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.072513  hitchhiker  0.00000250214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
286 aa  281  7.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.96 
 
 
280 aa  276  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0493  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.48 
 
 
274 aa  229  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.83 
 
 
248 aa  210  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.17 
 
 
248 aa  201  7e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.320188 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.17 
 
 
267 aa  201  8e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.38391  normal  0.963461 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1963  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.32 
 
 
248 aa  199  5e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075566  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.55 
 
 
248 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.84 
 
 
248 aa  191  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0729  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.7 
 
 
248 aa  188  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.535753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0549  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.34 
 
 
247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23318  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
224 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
224 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
224 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.41 
 
 
208 aa  93.6  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.48 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32 
 
 
227 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.88 
 
 
206 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.88 
 
 
206 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.36 
 
 
238 aa  86.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.72 
 
 
209 aa  86.3  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.51 
 
 
206 aa  86.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  30.37 
 
 
229 aa  85.9  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.84 
 
 
209 aa  85.9  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.1 
 
 
576 aa  85.9  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.4 
 
 
480 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.43 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 
218 aa  82  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.8 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.38 
 
 
230 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2672  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.38 
 
 
230 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.866778  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.68 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  43 
 
 
474 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.96 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.17 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.3 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.3 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.16 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  30.3 
 
 
236 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  32.03 
 
 
237 aa  79  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.73 
 
 
231 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.39 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  30.77 
 
 
236 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  34.09 
 
 
227 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.3 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.84 
 
 
206 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  28.87 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.43 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  29.95 
 
 
206 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  27.06 
 
 
470 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  37.96 
 
 
223 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.96 
 
 
210 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.48 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.41 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.47 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.73 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.7 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  40 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.1 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  28.98 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  32.32 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  29.94 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.9 
 
 
204 aa  74.7  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.4 
 
 
238 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.72 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  37.93 
 
 
211 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  37.93 
 
 
211 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  31.66 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.61 
 
 
208 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.92 
 
 
199 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.14 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  32.32 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.82 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000689785  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.36 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  26.94 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.29 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.55 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  26.94 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  26.94 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.11 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  42.57 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  26.94 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  26.94 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.94 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.94 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.58 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.7 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.47 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  28.85 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.85 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  27.8 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>