More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_25490 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  100 
 
 
211 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  100 
 
 
211 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  80.09 
 
 
210 aa  316  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  79.72 
 
 
211 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  81.46 
 
 
211 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  79.72 
 
 
224 aa  310  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  79.25 
 
 
224 aa  309  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  78.77 
 
 
224 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  74.04 
 
 
238 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  77.32 
 
 
200 aa  284  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  74.62 
 
 
214 aa  277  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.69 
 
 
208 aa  268  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.9 
 
 
214 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.92 
 
 
206 aa  244  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.56 
 
 
209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.96 
 
 
208 aa  232  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.1 
 
 
253 aa  229  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.11 
 
 
218 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.43 
 
 
210 aa  218  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  50.25 
 
 
204 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  53.96 
 
 
201 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.49 
 
 
203 aa  205  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.5 
 
 
202 aa  192  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.24 
 
 
207 aa  190  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.08 
 
 
204 aa  184  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  49.75 
 
 
220 aa  180  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.75 
 
 
220 aa  180  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.02 
 
 
201 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.41 
 
 
206 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.74 
 
 
220 aa  174  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  47.74 
 
 
220 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.63 
 
 
231 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.37 
 
 
192 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  45.81 
 
 
213 aa  155  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  40.29 
 
 
206 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.81 
 
 
206 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.67 
 
 
210 aa  148  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1318  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.92 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1060  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.6 
 
 
244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.962837 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.92 
 
 
212 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.92 
 
 
212 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.63 
 
 
221 aa  145  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.32 
 
 
206 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43 
 
 
206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43 
 
 
206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.1 
 
 
210 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.52 
 
 
208 aa  141  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.5 
 
 
207 aa  138  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.86 
 
 
216 aa  137  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.64 
 
 
206 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2947  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.57 
 
 
212 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  38.58 
 
 
229 aa  125  5e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.33 
 
 
238 aa  116  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  36.92 
 
 
474 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.64 
 
 
576 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.18 
 
 
218 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  36.65 
 
 
470 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.81 
 
 
212 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.88 
 
 
241 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.7 
 
 
216 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.2 
 
 
199 aa  101  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  35.57 
 
 
465 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.17 
 
 
339 aa  99.4  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  31.11 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3131  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.15 
 
 
274 aa  93.6  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.89 
 
 
209 aa  93.2  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.51 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.32 
 
 
243 aa  90.9  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.82 
 
 
478 aa  88.2  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  32.39 
 
 
234 aa  88.6  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.69 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.54 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.46 
 
 
480 aa  87.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  30.5 
 
 
220 aa  87.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.53 
 
 
235 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.47 
 
 
251 aa  86.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.95 
 
 
171 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.3 
 
 
252 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.3 
 
 
252 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.14 
 
 
237 aa  86.3  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.84 
 
 
226 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03434  putative Tol protein  32.63 
 
 
454 aa  85.9  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0966  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.28 
 
 
206 aa  85.5  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.15 
 
 
252 aa  85.1  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  27.09 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.69 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1865  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.05 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.646793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.05 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.66 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.3 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.18 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 
469 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  29.15 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.92 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.65 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.14 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.66 
 
 
457 aa  82.4  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.77 
 
 
227 aa  82  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1737  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.82 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.7 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>