More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4090 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 280 aa  566  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  53.96 
 
 		 275 aa  294  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0493  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.77 
 
 		 274 aa  290  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4055  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.08 
 
 		 279 aa  288  8e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.072513  hitchhiker  0.00000250214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.25 
 
 		 286 aa  288  9e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.12 
 
 		 277 aa  282  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0347861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  46.57 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.15 
 
 		 248 aa  199  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.41 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.38391  normal  0.963461 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.41 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.320188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1963  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.1 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.61 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0729  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.12 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.535753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0549  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.94 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23318  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.41 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.03 
 
 		 225 aa  89.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.16 
 
 		 199 aa  87  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.96 
 
 		 204 aa  86.7  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.79 
 
 		 218 aa  86.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.3 
 
 		 235 aa  86.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.06 
 
 		 241 aa  86.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  29.19 
 
 		 229 aa  86.3  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.87 
 
 		 238 aa  86.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.86 
 
 		 576 aa  85.5  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.1 
 
 		 224 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.1 
 
 		 224 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.1 
 
 		 224 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.74 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.18 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  29.55 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.22 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.37 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  32.66 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  28.48 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.85 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  28.48 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.22 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  28.48 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  28.48 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  30.72 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  29.15 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.59 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.33 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  28.64 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3392  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0363447  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.76 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2672  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.76 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.866778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.61 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.72 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.77 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.19 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.38 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  25.98 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  26.64 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.62 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  26.52 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.52 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  27.22 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  27.22 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  24.04 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  24.52 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.04 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  28.04 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  28.04 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  28.04 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  28.04 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  28.04 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.78 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  28.04 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.44 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.04 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.7 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  29.95 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  24.52 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  27.64 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.44 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  29.79 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.27 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.65 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.45 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108923  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  24.65 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.45 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  27.45 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.6 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.23 
 
 		 478 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3892  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.85 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  38.68 
 
 		 474 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0762  protein TolQ  34.13 
 
 		 225 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167492  normal  0.258035 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.04 
 
 		 237 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.11 
 
 		 237 aa  72  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0697  protein TolQ  33.08 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0803  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.85 
 
 		 225 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  31.9 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  33.85 
 
 		 225 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0680  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.08 
 
 		 242 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646362  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3917  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  34.13 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22506  normal  0.159351 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0772  protein TolQ  33.85 
 
 		 225 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0320  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.85 
 
 		 225 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  35.24 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2452  protein TolQ  34.13 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>