More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1976 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  70.91 
 
 
228 aa  330  8e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.93 
 
 
237 aa  191  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.63 
 
 
204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.15 
 
 
236 aa  180  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.84 
 
 
238 aa  164  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.97 
 
 
236 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.77 
 
 
226 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156891  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3579  biopolymer transport protein  40.6 
 
 
234 aa  146  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.159406  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  35.71 
 
 
229 aa  141  7e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.57 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.11 
 
 
246 aa  113  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.62 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.7 
 
 
241 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.17 
 
 
339 aa  96.7  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  32.31 
 
 
234 aa  95.5  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.39 
 
 
208 aa  91.7  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.07 
 
 
199 aa  91.3  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.69 
 
 
324 aa  90.1  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.05 
 
 
206 aa  89  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.43 
 
 
207 aa  88.6  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0782  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.89 
 
 
270 aa  87.8  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.53 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.57 
 
 
206 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
206 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.82 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 
576 aa  86.3  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.62 
 
 
204 aa  85.5  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 
218 aa  85.1  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.25 
 
 
206 aa  85.1  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.85 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.48 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  26.51 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  29.65 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  29.76 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.76 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  29.65 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  27.73 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0287  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.51 
 
 
216 aa  82  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.61 
 
 
280 aa  82  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.98 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.78 
 
 
248 aa  82  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.43 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.93 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  27.93 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  27.93 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.93 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  27.93 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.37 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  27.93 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  27.93 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.6 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.75 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  25.79 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  26.96 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.88 
 
 
231 aa  79  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  26.96 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  28.89 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.36 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.63 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2957  biopolymer transport proteins-like  33.68 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  29.48 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.11 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0680  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.73 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646362  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.37 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4055  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.8 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.072513  hitchhiker  0.00000250214 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3892  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.73 
 
 
246 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.37 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.71 
 
 
252 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.91 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.37 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.77 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.71 
 
 
252 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  27.93 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.45 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.41 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.44 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.52 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  33.83 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0697  protein TolQ  27.93 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.52 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  27.94 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  26.96 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0803  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.48 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.24 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0772  protein TolQ  27.48 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265235  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.54 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0320  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.48 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  28.97 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1228  putative adventurous gliding motility protein R  27.23 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258731  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.44 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.34 
 
 
655 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  27.62 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  28.64 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2452  protein TolQ  27.93 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1963  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.83 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.27 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.06 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2678  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.26 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>