More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3385 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156891  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.68 
 
 
236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.57 
 
 
237 aa  208  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.62 
 
 
236 aa  202  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.64 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3579  biopolymer transport protein  47.27 
 
 
234 aa  188  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.159406  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.16 
 
 
238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.67 
 
 
204 aa  155  4e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  36.92 
 
 
228 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  33.66 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.98 
 
 
234 aa  144  8.000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  28.57 
 
 
234 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.92 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.41 
 
 
210 aa  90.1  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
480 aa  88.6  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.23 
 
 
241 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.64 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  28.05 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.02 
 
 
208 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.24 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.97 
 
 
246 aa  82  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.34 
 
 
248 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.26 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.53 
 
 
576 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.88 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.02 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  22.73 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  27.92 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  27.92 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.73 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  25.89 
 
 
474 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
257 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.54 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  27.14 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.14 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.21 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.69 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.21 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1963  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.98 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.85 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.54 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.83 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.16 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.13 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  22.96 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  25.74 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  29.57 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.12 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.85 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  25.94 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.94 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  25.94 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.53 
 
 
229 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265292  hitchhiker  0.00010169 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.5 
 
 
199 aa  71.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  25 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  27.92 
 
 
465 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0782  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  24.29 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  24.55 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  24.43 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.47 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.27 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.25 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.13 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0729  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.98 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.535753  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0306  protein TolQ  27.16 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0846201  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2678  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.45 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  24.61 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  25.25 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.92 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.38 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0792  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.11 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.07 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2672  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.07 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.866778  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  25 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.17 
 
 
339 aa  68.9  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  25.66 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  21.08 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.11 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145562  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.9 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.67 
 
 
308 aa  68.2  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  22.61 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  21.08 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.15 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  28.57 
 
 
470 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.75 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  21.32 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  21.08 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143236  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.63 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.64 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.89 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1318  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.52 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.32 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.79 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.7 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.7 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.7 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.59 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.32 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1060  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.52 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.962837 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.04 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>